More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2914 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  65.28 
 
 
651 aa  897    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  64.56 
 
 
650 aa  901    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
650 aa  1349    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  65.02 
 
 
651 aa  905    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  44.05 
 
 
652 aa  531  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  43.59 
 
 
661 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  40.9 
 
 
644 aa  511  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  41.92 
 
 
657 aa  508  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  40.85 
 
 
649 aa  502  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  40.98 
 
 
636 aa  499  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  42.44 
 
 
663 aa  491  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  40.32 
 
 
645 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  41.24 
 
 
638 aa  487  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  41.24 
 
 
643 aa  485  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  40.93 
 
 
650 aa  482  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  41.7 
 
 
646 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  41.67 
 
 
650 aa  475  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  39.32 
 
 
667 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  41.62 
 
 
672 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  37.13 
 
 
639 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  40.03 
 
 
645 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  39.9 
 
 
642 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  37.76 
 
 
641 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  33.93 
 
 
638 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 
534 aa  234  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  29.69 
 
 
548 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  28.63 
 
 
553 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  27.27 
 
 
551 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  28.46 
 
 
553 aa  193  9e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  28.46 
 
 
572 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  28.27 
 
 
572 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  26.44 
 
 
591 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  29.18 
 
 
1100 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  24.96 
 
 
598 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  27.39 
 
 
1114 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  27.84 
 
 
596 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  27.36 
 
 
1100 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  27.84 
 
 
596 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  27.84 
 
 
596 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  27.12 
 
 
571 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  25.97 
 
 
1085 aa  187  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  27.86 
 
 
567 aa  187  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  27.72 
 
 
601 aa  187  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  25.87 
 
 
598 aa  186  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  26.02 
 
 
1088 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  27.29 
 
 
1100 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  26.15 
 
 
551 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  25.84 
 
 
1088 aa  185  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  25.84 
 
 
1088 aa  185  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  27.36 
 
 
1100 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  26.39 
 
 
601 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  26.81 
 
 
1110 aa  183  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  26.94 
 
 
606 aa  183  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  26.82 
 
 
1099 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  25.95 
 
 
1115 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  26.77 
 
 
1101 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  27.05 
 
 
604 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  27.57 
 
 
1093 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  26.63 
 
 
1100 aa  180  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  26.28 
 
 
562 aa  180  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  25 
 
 
1102 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  26.48 
 
 
1093 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  26.63 
 
 
1100 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  25.62 
 
 
682 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  26.58 
 
 
1154 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  27.94 
 
 
558 aa  178  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  27.14 
 
 
1101 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  26.39 
 
 
1152 aa  177  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  27.34 
 
 
1110 aa  177  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  27.24 
 
 
1113 aa  177  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  25.48 
 
 
1092 aa  177  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  29.2 
 
 
1130 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  26.72 
 
 
1139 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  25.7 
 
 
1113 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  28.27 
 
 
587 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  26.23 
 
 
1106 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  26.45 
 
 
591 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  27.15 
 
 
556 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  26.19 
 
 
1108 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  26.49 
 
 
577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  26.39 
 
 
1154 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  27.29 
 
 
1094 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  26.64 
 
 
583 aa  175  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  25.77 
 
 
1121 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  27.02 
 
 
582 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  25.21 
 
 
1102 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  25.09 
 
 
1121 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  25.82 
 
 
1102 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  25.09 
 
 
588 aa  174  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  25.61 
 
 
1088 aa  173  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  26.96 
 
 
1105 aa  173  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  27.95 
 
 
1108 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  26.24 
 
 
1100 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  26.86 
 
 
1105 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  24.5 
 
 
584 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  29.74 
 
 
1131 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  26.1 
 
 
567 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  25.69 
 
 
1108 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  25.96 
 
 
1088 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  29.19 
 
 
1104 aa  172  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>