More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0308 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  63.46 
 
 		 644 aa  791    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  55.03 
 
 		 657 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  56.75 
 
 		 639 aa  665    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  100 
 
 		 636 aa  1301    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  65.01 
 
 		 650 aa  758    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  55.57 
 
 		 645 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  46.34 
 
 		 661 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  54.78 
 
 		 667 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  45.95 
 
 		 652 aa  532  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  47.61 
 
 		 650 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  44.87 
 
 		 650 aa  510  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  43.11 
 
 		 645 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  41.88 
 
 		 651 aa  511  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  45.39 
 
 		 638 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  42.96 
 
 		 651 aa  503  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  42.93 
 
 		 646 aa  499  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  40.98 
 
 		 650 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  46.7 
 
 		 663 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  42.7 
 
 		 643 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  46.93 
 
 		 638 aa  485  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  43.42 
 
 		 672 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  39.17 
 
 		 649 aa  482  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  45.71 
 
 		 642 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  41.05 
 
 		 641 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  27.5 
 
 		 534 aa  197  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  30.58 
 
 		 1085 aa  191  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  27.51 
 
 		 553 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  27.37 
 
 		 1114 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  27.44 
 
 		 1093 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  27.03 
 
 		 572 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  27.23 
 
 		 553 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  26.55 
 
 		 551 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  29.16 
 
 		 1088 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  28.03 
 
 		 1094 aa  181  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  26.98 
 
 		 572 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  25.81 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  27.41 
 
 		 1093 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  28.19 
 
 		 1092 aa  178  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  29.88 
 
 		 1099 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  26.23 
 
 		 1099 aa  177  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  27.79 
 
 		 1139 aa  177  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  27.96 
 
 		 964 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  28.06 
 
 		 1088 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  26.49 
 
 		 1104 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  25.94 
 
 		 1098 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  27.12 
 
 		 1061 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  28.06 
 
 		 1088 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  28.06 
 
 		 1088 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  26.05 
 
 		 1100 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  28.73 
 
 		 1154 aa  173  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  28 
 
 		 1100 aa  173  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  25.13 
 
 		 1109 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  27.89 
 
 		 1112 aa  173  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  26.98 
 
 		 1123 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  26.16 
 
 		 1098 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  26.12 
 
 		 1100 aa  172  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  28.41 
 
 		 1154 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  26.51 
 
 		 562 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  25.55 
 
 		 1108 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  27.63 
 
 		 1152 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  27.97 
 
 		 1113 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  28.6 
 
 		 1100 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  26.25 
 
 		 551 aa  171  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  28.93 
 
 		 1094 aa  170  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  33.33 
 
 		 556 aa  170  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  26.28 
 
 		 606 aa  170  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  25.27 
 
 		 1142 aa  170  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  27.96 
 
 		 1088 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  25.91 
 
 		 1134 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1160 aa  169  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  28.19 
 
 		 1100 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  29.16 
 
 		 1136 aa  169  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  26.07 
 
 		 1101 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  27.52 
 
 		 571 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  25.34 
 
 		 1119 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  25.81 
 
 		 1098 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  24.96 
 
 		 567 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  28.38 
 
 		 1098 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  27.64 
 
 		 1101 aa  168  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  31.29 
 
 		 558 aa  167  5e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  25.59 
 
 		 1112 aa  167  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  30.94 
 
 		 1095 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  29.2 
 
 		 1108 aa  167  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  28.38 
 
 		 1164 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  28.38 
 
 		 1164 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  26.14 
 
 		 601 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  25.75 
 
 		 1111 aa  167  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  28.73 
 
 		 1137 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  29.4 
 
 		 1131 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  29.4 
 
 		 1131 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  29.4 
 
 		 1131 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  28.89 
 
 		 1131 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  26.25 
 
 		 577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  25.27 
 
 		 1121 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  29.4 
 
 		 1131 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  27.02 
 
 		 1108 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  29.02 
 
 		 1137 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  28.73 
 
 		 1137 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  29.02 
 
 		 1137 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  29.02 
 
 		 1137 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>