More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0972 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  63.46 
 
 
636 aa  806    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  59.64 
 
 
639 aa  710    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  53.72 
 
 
657 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  63.62 
 
 
650 aa  798    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
644 aa  1332    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  55.81 
 
 
645 aa  658    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  48.6 
 
 
661 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  54 
 
 
667 aa  571  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  48.14 
 
 
652 aa  558  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  42.83 
 
 
650 aa  551  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  43.32 
 
 
651 aa  531  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  41.88 
 
 
651 aa  527  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  44.66 
 
 
650 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  40.9 
 
 
650 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  43.07 
 
 
663 aa  508  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  42.25 
 
 
645 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  44.6 
 
 
642 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  44.16 
 
 
638 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  45.43 
 
 
672 aa  507  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  44.78 
 
 
643 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  40.47 
 
 
649 aa  502  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  40.22 
 
 
646 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  41.45 
 
 
638 aa  458  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  37.23 
 
 
641 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  29.4 
 
 
1101 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  30.14 
 
 
1099 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  29.65 
 
 
553 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  29.44 
 
 
1100 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  28.7 
 
 
551 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  26.92 
 
 
548 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  28.98 
 
 
1085 aa  192  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  28.36 
 
 
1088 aa  193  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  28.95 
 
 
553 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  28.95 
 
 
572 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  27.48 
 
 
551 aa  192  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  29.02 
 
 
572 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  28.01 
 
 
1100 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  28.97 
 
 
1100 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  29.14 
 
 
1094 aa  191  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  28.27 
 
 
1100 aa  190  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  28.42 
 
 
1142 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  27.6 
 
 
1152 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  27.85 
 
 
1100 aa  187  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  26.72 
 
 
534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  27.72 
 
 
1154 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  27.51 
 
 
1088 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  29.1 
 
 
556 aa  183  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  27.84 
 
 
1108 aa  183  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  27.41 
 
 
1094 aa  182  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  28.32 
 
 
1108 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  29.1 
 
 
1093 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  27.84 
 
 
1119 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  26.65 
 
 
1092 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  26.81 
 
 
1114 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  27.02 
 
 
1102 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  27.51 
 
 
1088 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  27.88 
 
 
1099 aa  181  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  27.51 
 
 
1088 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  27.77 
 
 
1100 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  27.48 
 
 
1154 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  27.06 
 
 
1121 aa  180  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  27.82 
 
 
1139 aa  180  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  30 
 
 
1093 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  27.74 
 
 
1113 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  27.65 
 
 
1112 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  28.22 
 
 
1104 aa  178  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  36.3 
 
 
1109 aa  178  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  26.96 
 
 
1098 aa  177  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  27.36 
 
 
1111 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  27.4 
 
 
1102 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  27.46 
 
 
1098 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  27.38 
 
 
1102 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  28.07 
 
 
1130 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  27.89 
 
 
1100 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  27.89 
 
 
1100 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  26.98 
 
 
1116 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  27.88 
 
 
1108 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  26.89 
 
 
1098 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  28.32 
 
 
1112 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  27.72 
 
 
1100 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  25.81 
 
 
584 aa  174  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  27.46 
 
 
1113 aa  174  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  27.45 
 
 
1108 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  27.99 
 
 
1100 aa  173  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  27.89 
 
 
1110 aa  173  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  27.57 
 
 
1061 aa  173  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  27.29 
 
 
1116 aa  173  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  26.68 
 
 
1088 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  27.72 
 
 
567 aa  173  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  28.57 
 
 
1115 aa  173  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  26.11 
 
 
1123 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  28.21 
 
 
1101 aa  173  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  25.91 
 
 
571 aa  173  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  27.4 
 
 
1137 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  27.4 
 
 
1137 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  27.9 
 
 
598 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  26.26 
 
 
1109 aa  171  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  26.53 
 
 
1098 aa  171  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  27.91 
 
 
585 aa  170  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  29.19 
 
 
1134 aa  170  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>