More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00676 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  52.23 
 
 
641 aa  685    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  50.94 
 
 
652 aa  676    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  100 
 
 
649 aa  1359    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  63.04 
 
 
645 aa  862    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  61.76 
 
 
646 aa  811    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  47.98 
 
 
650 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  48.59 
 
 
638 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  48.29 
 
 
663 aa  605  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  48.39 
 
 
672 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  47.17 
 
 
643 aa  598  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  44.31 
 
 
642 aa  567  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  41.31 
 
 
650 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  39.69 
 
 
651 aa  505  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  40.85 
 
 
650 aa  502  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  41.1 
 
 
651 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  40.47 
 
 
644 aa  498  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  40.67 
 
 
650 aa  483  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  39.17 
 
 
636 aa  482  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  39.65 
 
 
661 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  40.5 
 
 
657 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  41.54 
 
 
667 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  39.5 
 
 
639 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  37.77 
 
 
638 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  36.6 
 
 
645 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  28.86 
 
 
1088 aa  213  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  28.86 
 
 
1088 aa  213  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  28.49 
 
 
1088 aa  211  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  27.81 
 
 
1092 aa  208  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 
534 aa  206  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  28.49 
 
 
1088 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  27.86 
 
 
1085 aa  200  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  26.9 
 
 
551 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  27.86 
 
 
1094 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  26.12 
 
 
1139 aa  198  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  27.5 
 
 
551 aa  197  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  28.49 
 
 
1088 aa  197  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  26.87 
 
 
1115 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  27.21 
 
 
1121 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  27.24 
 
 
1114 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  26.08 
 
 
548 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  26.22 
 
 
553 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  25.58 
 
 
1093 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  25.5 
 
 
1093 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  27.26 
 
 
1108 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  26.45 
 
 
1110 aa  191  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  27.12 
 
 
1102 aa  191  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  25.98 
 
 
572 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  25.88 
 
 
1119 aa  190  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  26.28 
 
 
1100 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  26.2 
 
 
572 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  26.2 
 
 
553 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  27.41 
 
 
610 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  25.13 
 
 
1100 aa  189  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  27.41 
 
 
1100 aa  188  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  26.11 
 
 
1110 aa  187  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  26.3 
 
 
1098 aa  187  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  26.6 
 
 
1100 aa  186  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  27.31 
 
 
1108 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  26.75 
 
 
1102 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  26.87 
 
 
606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  26.75 
 
 
1102 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  24.66 
 
 
1112 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  26.96 
 
 
1121 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  26.13 
 
 
1108 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  25.95 
 
 
1100 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  24.62 
 
 
1111 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  26.28 
 
 
1100 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  26.29 
 
 
1100 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  26.87 
 
 
567 aa  183  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  26.26 
 
 
1106 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  26.49 
 
 
1061 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  26.26 
 
 
1106 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  26.02 
 
 
1113 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  26.24 
 
 
1106 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  26.47 
 
 
1105 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  26.27 
 
 
1104 aa  181  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  25.92 
 
 
1152 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  26.03 
 
 
1088 aa  181  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  26.7 
 
 
556 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  26.33 
 
 
598 aa  180  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  25.6 
 
 
1095 aa  180  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  25.85 
 
 
1099 aa  180  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  25.32 
 
 
1116 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  26.31 
 
 
682 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  26.79 
 
 
1109 aa  179  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  25.74 
 
 
1154 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  25.83 
 
 
1101 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  26.22 
 
 
1108 aa  179  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  25.67 
 
 
567 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  24.95 
 
 
1116 aa  178  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  26.09 
 
 
598 aa  178  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  26.28 
 
 
1130 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  26.77 
 
 
1136 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  25.67 
 
 
1100 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  25.74 
 
 
1154 aa  177  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  25.58 
 
 
1113 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  25.59 
 
 
1100 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  24.96 
 
 
1098 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  25.27 
 
 
1123 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  25.5 
 
 
591 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>