More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0324 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  53.26 
 
 		 646 aa  701    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  52.23 
 
 		 649 aa  685    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  49.38 
 
 		 645 aa  650    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 641 aa  1331    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  49.24 
 
 		 652 aa  580  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  47.39 
 
 		 650 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  45.63 
 
 		 643 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  44.52 
 
 		 663 aa  533  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  47.14 
 
 		 638 aa  534  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  43.37 
 
 		 672 aa  515  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  44.15 
 
 		 642 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  39.27 
 
 		 651 aa  442  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  38.51 
 
 		 650 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  39.83 
 
 		 657 aa  435  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  40.07 
 
 		 651 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  39.6 
 
 		 661 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  37.85 
 
 		 667 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  36.93 
 
 		 644 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  41.05 
 
 		 636 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  40 
 
 		 650 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  37.76 
 
 		 650 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  38.32 
 
 		 639 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  38.7 
 
 		 645 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  34.15 
 
 		 638 aa  353  5e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  28.85 
 
 		 551 aa  216  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  28.14 
 
 		 1088 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  26.64 
 
 		 1115 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  28.14 
 
 		 1088 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  28.89 
 
 		 1088 aa  207  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  26.96 
 
 		 534 aa  207  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  28.14 
 
 		 1092 aa  206  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  27.4 
 
 		 1101 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  26.47 
 
 		 548 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  26.92 
 
 		 1121 aa  204  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  27.58 
 
 		 1085 aa  204  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  26.34 
 
 		 1100 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  27.19 
 
 		 1099 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  26.4 
 
 		 1102 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  27.13 
 
 		 1100 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  27.79 
 
 		 553 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  28.18 
 
 		 553 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  28.18 
 
 		 572 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  28.21 
 
 		 606 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  26.09 
 
 		 1094 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  26.73 
 
 		 1104 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  27.98 
 
 		 572 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  25.52 
 
 		 1088 aa  198  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  26.53 
 
 		 1088 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  25.32 
 
 		 1100 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  27.02 
 
 		 556 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  26.39 
 
 		 1088 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  28.02 
 
 		 682 aa  196  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  27.76 
 
 		 601 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  25.86 
 
 		 1102 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  26.63 
 
 		 598 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  26.55 
 
 		 1095 aa  195  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  25.74 
 
 		 1114 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  25.88 
 
 		 1100 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  26.38 
 
 		 1108 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  27.2 
 
 		 1094 aa  195  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  25.72 
 
 		 1102 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  26.2 
 
 		 1101 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  26.53 
 
 		 1139 aa  194  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  26.72 
 
 		 610 aa  194  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  25.74 
 
 		 1098 aa  194  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  27.51 
 
 		 577 aa  194  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  25.97 
 
 		 1116 aa  193  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  26.09 
 
 		 1106 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  27.43 
 
 		 1108 aa  193  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  26.44 
 
 		 1154 aa  193  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  26.09 
 
 		 1106 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  25.74 
 
 		 1105 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  26.73 
 
 		 1119 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  27.15 
 
 		 567 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  26.03 
 
 		 1131 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  24.75 
 
 		 1105 aa  192  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  26.03 
 
 		 1131 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  25.42 
 
 		 1116 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  26.58 
 
 		 1106 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  26.03 
 
 		 1131 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  26.03 
 
 		 1131 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  26.03 
 
 		 1131 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  26.05 
 
 		 1105 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  26.44 
 
 		 598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  27.08 
 
 		 1108 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  25.27 
 
 		 1142 aa  191  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  26.09 
 
 		 1093 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  26.37 
 
 		 588 aa  190  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  25.68 
 
 		 1154 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  25.85 
 
 		 1131 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  26.94 
 
 		 1113 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  28.6 
 
 		 1108 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  25.88 
 
 		 1152 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  25.57 
 
 		 1109 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  25.92 
 
 		 1110 aa  189  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  25.35 
 
 		 1098 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  24.61 
 
 		 1110 aa  187  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  26.44 
 
 		 567 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  27.4 
 
 		 1130 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  25.68 
 
 		 1137 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>