More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1096 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  54.84 
 
 
1088 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  54.64 
 
 
1092 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  56.33 
 
 
1108 aa  637    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  55.85 
 
 
1119 aa  650    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  56.99 
 
 
553 aa  648    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  57.31 
 
 
548 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  59.32 
 
 
604 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  60.29 
 
 
591 aa  687    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  60.59 
 
 
601 aa  713    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  58.03 
 
 
553 aa  654    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  71.6 
 
 
583 aa  861    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  61.23 
 
 
606 aa  704    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  55.39 
 
 
551 aa  650    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  68.04 
 
 
598 aa  813    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  61.4 
 
 
610 aa  723    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  57.88 
 
 
551 aa  667    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  57.53 
 
 
558 aa  636    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  56.99 
 
 
572 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  75.91 
 
 
585 aa  889    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  54.66 
 
 
1088 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  56.38 
 
 
572 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  60.68 
 
 
574 aa  694    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  55.88 
 
 
1123 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  76.17 
 
 
588 aa  933    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  54.46 
 
 
1088 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  58.71 
 
 
562 aa  678    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  58.73 
 
 
582 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  63.67 
 
 
596 aa  707    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  68.87 
 
 
616 aa  796    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  79.79 
 
 
591 aa  957    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  62.43 
 
 
577 aa  708    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  54.1 
 
 
1088 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  59.17 
 
 
556 aa  682    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  63.67 
 
 
596 aa  708    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  61.51 
 
 
682 aa  712    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  54.46 
 
 
1088 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  100 
 
 
587 aa  1211    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  60.81 
 
 
567 aa  696    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  61.05 
 
 
601 aa  704    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  74.15 
 
 
567 aa  854    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  67.32 
 
 
598 aa  808    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  62.11 
 
 
572 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  61.83 
 
 
556 aa  716    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  62.34 
 
 
571 aa  717    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  63.67 
 
 
596 aa  708    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  55.99 
 
 
1100 aa  632  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  55.76 
 
 
1112 aa  633  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  56.25 
 
 
1108 aa  631  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  55.94 
 
 
1121 aa  634  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  56.02 
 
 
1115 aa  634  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  55.96 
 
 
1111 aa  628  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  56.17 
 
 
1099 aa  630  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  53.11 
 
 
1114 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  54.38 
 
 
1102 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  55.08 
 
 
1098 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  53.85 
 
 
1102 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  54.05 
 
 
1108 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  53.96 
 
 
1108 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  54.33 
 
 
1116 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  53.85 
 
 
1102 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  55.17 
 
 
1098 aa  622  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  55.35 
 
 
1110 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  54.33 
 
 
1116 aa  624  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  54.23 
 
 
1105 aa  622  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  54.89 
 
 
1105 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  55.07 
 
 
1106 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  54.2 
 
 
1121 aa  618  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  54.53 
 
 
1106 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  54.53 
 
 
1106 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  53.94 
 
 
1113 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  54.7 
 
 
1098 aa  617  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  53.9 
 
 
1130 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  54.14 
 
 
1164 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  53.75 
 
 
1139 aa  612  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  52.77 
 
 
1094 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  54.14 
 
 
1164 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  55.6 
 
 
1101 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  54.14 
 
 
1100 aa  611  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  54.34 
 
 
1108 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  53.59 
 
 
1088 aa  610  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  51.84 
 
 
1085 aa  610  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  53.8 
 
 
1100 aa  611  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  54.11 
 
 
1137 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  54.33 
 
 
1160 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  53.48 
 
 
1104 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  53.1 
 
 
1093 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  52.61 
 
 
1112 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  54.11 
 
 
1137 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  53.33 
 
 
1136 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  55.24 
 
 
1137 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  53.02 
 
 
1109 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  52 
 
 
1100 aa  602  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  53.72 
 
 
1100 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  53.87 
 
 
1099 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  53.42 
 
 
1134 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  54.45 
 
 
1110 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  55.24 
 
 
1137 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  52.6 
 
 
1105 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  54.04 
 
 
1109 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  55.24 
 
 
1137 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>