110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3748 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 484 aa  961    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  59.33 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  56.07 
 
 		 492 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  40.91 
 
 		 480 aa  332  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  42.55 
 
 		 493 aa  332  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  41.96 
 
 		 505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  40.05 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  38.33 
 
 		 482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  39.75 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  34.18 
 
 		 485 aa  302  1e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  38.15 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  37.08 
 
 		 513 aa  299  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  35.87 
 
 		 493 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  35.87 
 
 		 493 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  39.59 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  27.97 
 
 		 1214 aa  146  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  27.93 
 
 		 1193 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  26.79 
 
 		 1153 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  26.62 
 
 		 1177 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  25.66 
 
 		 1173 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  27.58 
 
 		 1118 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  25.53 
 
 		 1181 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  26.87 
 
 		 1101 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  25.46 
 
 		 1253 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  26.86 
 
 		 1118 aa  133  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  24.88 
 
 		 1202 aa  127  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  27.03 
 
 		 1229 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  26.21 
 
 		 1231 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  24.03 
 
 		 1186 aa  123  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  24.51 
 
 		 1165 aa  121  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  22.99 
 
 		 1172 aa  120  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  23.72 
 
 		 1167 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  23.54 
 
 		 1201 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  23.54 
 
 		 1164 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  24.7 
 
 		 1128 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  23.89 
 
 		 1144 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  29.64 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  24.22 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  25.98 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  23.86 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  27.95 
 
 		 758 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  22.91 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  28.74 
 
 		 565 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  23.77 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  22.05 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  21.56 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  24.72 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  26.38 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  25.6 
 
 		 579 aa  60.1  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  27.19 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  21.24 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  28.48 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  25.86 
 
 		 535 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  27.06 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  26.51 
 
 		 728 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  22.74 
 
 		 511 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  23.81 
 
 		 1048 aa  53.5  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  23.58 
 
 		 673 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  24.37 
 
 		 650 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  25.2 
 
 		 529 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  22.2 
 
 		 581 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  27.08 
 
 		 528 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 		 510 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  26.27 
 
 		 574 aa  50.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  24.58 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  23.93 
 
 		 709 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  24.58 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  24.73 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  28.16 
 
 		 525 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  24.18 
 
 		 537 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  26.77 
 
 		 546 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  47.92 
 
 		 614 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  25.18 
 
 		 630 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 448 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  27.92 
 
 		 561 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  24.52 
 
 		 535 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  24.01 
 
 		 595 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  20.98 
 
 		 583 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  24.68 
 
 		 575 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  28.16 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  26.89 
 
 		 532 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 619 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  22.86 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  25.73 
 
 		 541 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  27.72 
 
 		 547 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  25.7 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  24.88 
 
 		 540 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  26.29 
 
 		 542 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0587  alpha amylase catalytic region  27.55 
 
 		 552 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  32.56 
 
 		 554 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  21.89 
 
 		 623 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  24.18 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  23.16 
 
 		 610 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  24.02 
 
 		 605 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  25.54 
 
 		 674 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1461  malto-oligosyltrehalose synthase  41.3 
 
 		 950 aa  43.9  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 543 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  24.02 
 
 		 605 aa  43.5  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>