84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2220 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1727  alpha amylase catalytic region  66.25 
 
 		 493 aa  699    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0452  alpha amylase domain-containing protein  68.48 
 
 		 480 aa  714    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0323789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0673  alpha amylase, catalytic region  66.04 
 
 		 505 aa  684    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1416  alpha amylase domain-containing protein  60.17 
 
 		 481 aa  644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2220  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 480 aa  1011    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  58.54 
 
 		 481 aa  600  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  57.08 
 
 		 482 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  36.27 
 
 		 493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  36.27 
 
 		 493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3748  alpha amylase catalytic region  40.05 
 
 		 484 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0407  alpha amylase, catalytic region  38.04 
 
 		 492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  37.76 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5268  alpha amylase catalytic region  41.12 
 
 		 497 aa  296  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  37.65 
 
 		 493 aa  296  8e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  35.38 
 
 		 513 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1970  alpha amylase catalytic region  26.26 
 
 		 1214 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0403753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2077  alpha amylase catalytic region  25.85 
 
 		 1231 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1485  alpha amylase, catalytic region  26.1 
 
 		 1229 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  26.12 
 
 		 1253 aa  147  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2955  alpha amylase  24.76 
 
 		 1101 aa  147  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0468  alpha amylase catalytic region  24.77 
 
 		 1186 aa  143  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3212  alpha amylase catalytic region  25.18 
 
 		 1128 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1982  alpha amylase catalytic region  25.36 
 
 		 1173 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1492  alpha amylase  26.37 
 
 		 1202 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0601  alpha amylase family protein  26.19 
 
 		 1193 aa  140  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1717  alpha amylase domain-containing protein  24.07 
 
 		 1165 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00712289  normal  0.510811 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2678  alpha-amylase family protein  24.58 
 
 		 1201 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3591  alpha amylase, catalytic region  25.17 
 
 		 1153 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.613742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0431  alpha amylase, catalytic region  23.09 
 
 		 1167 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1778  alpha amylase catalytic region  23.21 
 
 		 1164 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.288159  decreased coverage  0.00472936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0263  alpha amylase domain-containing protein  24.48 
 
 		 1144 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.250849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0683  alpha amylase catalytic region  25.32 
 
 		 1118 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000715113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0695  alpha amylase catalytic region  25.32 
 
 		 1118 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000568993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0517  alpha amylase, catalytic region  24.08 
 
 		 1177 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.824032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2918  Alpha amylase, catalytic region  24.6 
 
 		 1181 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0363  alpha amylase catalytic region  23.85 
 
 		 1172 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0898121  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  27.17 
 
 		 459 aa  93.2  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  22.1 
 
 		 434 aa  90.5  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  24.31 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  26.67 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  26.81 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  27.24 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  25.55 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  22.55 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  24.92 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  22.5 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  26.05 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  23.49 
 
 		 574 aa  65.9  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  20.49 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  23.31 
 
 		 579 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  20.76 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1294  alpha amylase, catalytic domain protein  22.32 
 
 		 566 aa  60.1  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  21.69 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  20.47 
 
 		 728 aa  57.4  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  23.51 
 
 		 630 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  21.81 
 
 		 499 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  24.18 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  24.87 
 
 		 687 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  24.8 
 
 		 524 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  21.51 
 
 		 624 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  23.73 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  25.08 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  23 
 
 		 534 aa  51.2  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  24.43 
 
 		 677 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.14 
 
 		 1647 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  26.21 
 
 		 581 aa  50.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  21.44 
 
 		 610 aa  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  22.67 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  20.82 
 
 		 605 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  24.93 
 
 		 758 aa  47  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  48.84 
 
 		 1633 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  20.92 
 
 		 650 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  20.86 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  29.03 
 
 		 643 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  46.51 
 
 		 1642 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  25.49 
 
 		 1124 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  21.05 
 
 		 709 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  24.5 
 
 		 666 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  21.52 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  22.6 
 
 		 1136 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  22.53 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  19.79 
 
 		 617 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0981  glycogen branching enzyme  21.05 
 
 		 652 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.37129  normal  0.433168 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  21.69 
 
 		 402 aa  43.1  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>