More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2149 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1967  alpha amylase, catalytic region  60.34 
 
 		 536 aa  680    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000720647  hitchhiker  0.000000000127887 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0222  alpha amylase, catalytic region  60.83 
 
 		 529 aa  646    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0439399 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2149  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 532 aa  1087    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  30.29 
 
 		 644 aa  158  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  31.01 
 
 		 464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  26.12 
 
 		 610 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  30.23 
 
 		 580 aa  108  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.59 
 
 		 610 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  26.22 
 
 		 481 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  24.3 
 
 		 584 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  25.45 
 
 		 575 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  25.44 
 
 		 574 aa  97.8  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  30.56 
 
 		 413 aa  97.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  25.37 
 
 		 586 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.49 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  28.96 
 
 		 442 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  24.51 
 
 		 459 aa  94.4  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  27.87 
 
 		 576 aa  94.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  28.01 
 
 		 614 aa  94  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  27.65 
 
 		 473 aa  93.6  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  27.65 
 
 		 473 aa  93.6  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  30.38 
 
 		 608 aa  93.2  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  27.41 
 
 		 558 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  24.44 
 
 		 576 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  29.24 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  25.3 
 
 		 617 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  28.06 
 
 		 433 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  26.4 
 
 		 522 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  28.06 
 
 		 433 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  27.74 
 
 		 433 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  27.51 
 
 		 758 aa  91.3  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  23.21 
 
 		 663 aa  91.3  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 		 586 aa  90.9  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  24.67 
 
 		 589 aa  90.9  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  26.71 
 
 		 605 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 587 aa  90.5  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  24.51 
 
 		 589 aa  90.5  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  25.89 
 
 		 596 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  28.09 
 
 		 595 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  27.22 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  24.2 
 
 		 586 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  25.31 
 
 		 493 aa  89.4  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  24.2 
 
 		 586 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  26.48 
 
 		 605 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  26.48 
 
 		 605 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  25.46 
 
 		 569 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  26.48 
 
 		 605 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  25.99 
 
 		 635 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  25.43 
 
 		 586 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  27.02 
 
 		 586 aa  87.8  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  25.7 
 
 		 488 aa  87.8  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  23.38 
 
 		 574 aa  87.4  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2159  alpha amylase catalytic region  25.45 
 
 		 647 aa  86.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  26.67 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  26.67 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  26.67 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  26.67 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  26.72 
 
 		 578 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  23.14 
 
 		 608 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  27.52 
 
 		 590 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  25.81 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  24.2 
 
 		 586 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  26.77 
 
 		 682 aa  84.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  25.37 
 
 		 588 aa  84  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  24.18 
 
 		 555 aa  84  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  25.36 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  27.09 
 
 		 728 aa  83.2  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  23.53 
 
 		 515 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  24.18 
 
 		 555 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  28.05 
 
 		 427 aa  83.2  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  21.91 
 
 		 583 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  27.58 
 
 		 600 aa  82.4  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  28.62 
 
 		 593 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  27.25 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  21.98 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0747  alpha amylase, catalytic region  28.15 
 
 		 655 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.29476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  26.81 
 
 		 607 aa  80.5  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  25.85 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  25.23 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  27.09 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  27.09 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  27.27 
 
 		 604 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  27.09 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  27.09 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  27.09 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  27.09 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  27.09 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  23.51 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  24.19 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  24.67 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  23.94 
 
 		 622 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.24 
 
 		 481 aa  76.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  27.18 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 441 aa  76.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  26.2 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>