More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1603 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1603  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
554 aa  1125    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000968128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  46.1 
 
 
554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  44.39 
 
 
554 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  42.48 
 
 
562 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  44.87 
 
 
554 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  44.89 
 
 
554 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  43.43 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  43.22 
 
 
554 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  44.7 
 
 
554 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  44.7 
 
 
554 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  44.7 
 
 
554 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  44.7 
 
 
554 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  44.7 
 
 
554 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  44.32 
 
 
554 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  41.89 
 
 
557 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  43.91 
 
 
554 aa  438  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  42.6 
 
 
554 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  40.85 
 
 
563 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  42.23 
 
 
555 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  40.79 
 
 
568 aa  430  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  41.64 
 
 
562 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  40 
 
 
558 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  39.79 
 
 
558 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  40 
 
 
558 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  39.79 
 
 
558 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  39.25 
 
 
558 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  39.65 
 
 
558 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  39.82 
 
 
558 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  39.65 
 
 
558 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  39.82 
 
 
558 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  39.61 
 
 
558 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  38.58 
 
 
559 aa  415  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  36.63 
 
 
577 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.43 
 
 
561 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  38.61 
 
 
549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  40.93 
 
 
538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  38.61 
 
 
549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  39.42 
 
 
572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0078  alpha,alpha-phosphotrehalase  39.72 
 
 
556 aa  404  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.220549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  38.67 
 
 
556 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  39.6 
 
 
582 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.96 
 
 
556 aa  404  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.79 
 
 
560 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.36 
 
 
562 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.54 
 
 
553 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.88 
 
 
562 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  38.57 
 
 
561 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  38.97 
 
 
566 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.07 
 
 
553 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.89 
 
 
553 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  40.93 
 
 
553 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.07 
 
 
553 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  40.89 
 
 
553 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  39.27 
 
 
560 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.89 
 
 
553 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  38.27 
 
 
570 aa  399  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  43.49 
 
 
536 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.46 
 
 
556 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  39.08 
 
 
563 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  39.58 
 
 
551 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.71 
 
 
553 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.14 
 
 
554 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  39.56 
 
 
546 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.36 
 
 
553 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.99 
 
 
555 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  40.3 
 
 
556 aa  389  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.34 
 
 
561 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  39.56 
 
 
546 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  37.81 
 
 
557 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  39.47 
 
 
554 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.32 
 
 
563 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.76 
 
 
531 aa  385  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.57 
 
 
538 aa  388  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  39.03 
 
 
600 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  39.82 
 
 
553 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  36.64 
 
 
590 aa  383  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.3 
 
 
551 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  38.87 
 
 
563 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.62 
 
 
560 aa  383  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.42 
 
 
556 aa  384  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  39.85 
 
 
643 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  41.05 
 
 
535 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  38.08 
 
 
552 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  37.3 
 
 
551 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  35.47 
 
 
557 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.76 
 
 
550 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.15 
 
 
551 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  38.66 
 
 
606 aa  378  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  38.95 
 
 
551 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.58 
 
 
550 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2575  alpha amylase catalytic region  38.52 
 
 
604 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.260702  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.95 
 
 
551 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.76 
 
 
550 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.76 
 
 
551 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.62 
 
 
560 aa  375  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.22 
 
 
550 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.76 
 
 
551 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  38.95 
 
 
551 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.58 
 
 
550 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.65 
 
 
551 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>