243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0143 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0143  alpha amylase catalytic sub domain protein  100 
 
 		 692 aa  1424    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0052779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0159  hypothetical protein  45.01 
 
 		 637 aa  526  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00185609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0161  alpha amylase, catalytic region  45.01 
 
 		 637 aa  526  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00960046  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1144  alpha amylase catalytic region  43.83 
 
 		 669 aa  524  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00833327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0458  alpha amylase, catalytic region  43.11 
 
 		 663 aa  499  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0463  alpha amylase domain-containing protein  43.14 
 
 		 676 aa  497  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.694726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1524  alpha-amylase family protein  31.66 
 
 		 636 aa  269  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0281474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1122  alpha-amylase family protein  31.53 
 
 		 629 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110561  normal  0.457089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1356  alpha amylase catalytic region  31.69 
 
 		 642 aa  254  4.0000000000000004e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000107731  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1085  alpha-amylase family protein  32.82 
 
 		 649 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1176  alpha-amylase family protein  29.47 
 
 		 634 aa  248  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.470418  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0963  alpha-amylase family protein  30.13 
 
 		 638 aa  247  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1381  alpha-amylase family protein  29.48 
 
 		 661 aa  241  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  33.63 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  26.9 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  22.98 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  34.02 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  27.85 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  30.56 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  27.97 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1884  alpha amylase, catalytic region  36.52 
 
 		 684 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3482  alpha amylase, catalytic region  35.65 
 
 		 651 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  29.17 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  34.78 
 
 		 651 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  28.16 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  22.81 
 
 		 653 aa  64.7  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  22.94 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.36 
 
 		 1433 aa  62.4  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  26.71 
 
 		 630 aa  62.4  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  30.63 
 
 		 752 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  26.43 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  31.21 
 
 		 715 aa  61.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  32.82 
 
 		 1124 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  32.82 
 
 		 1124 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  29.25 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  33.33 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 1122 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 1151 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  21.68 
 
 		 581 aa  59.7  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  25.26 
 
 		 667 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  26.17 
 
 		 668 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  29.13 
 
 		 1115 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  29.08 
 
 		 1148 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  29.08 
 
 		 1136 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  29.08 
 
 		 1115 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  29.08 
 
 		 1115 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  29.13 
 
 		 1115 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  32.48 
 
 		 1133 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  31.43 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  32.48 
 
 		 1136 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  31.21 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28010  family 13 glycosyl hydrolase  30.77 
 
 		 667 aa  57.4  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  31.62 
 
 		 1146 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 426 aa  57  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3860  alpha amylase, catalytic region  26.14 
 
 		 695 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  22.33 
 
 		 676 aa  56.6  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3934  alpha amylase, catalytic region  26.14 
 
 		 695 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.538651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3846  alpha amylase, catalytic region  26.14 
 
 		 695 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0237577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 1122 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  32.48 
 
 		 1074 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1209  alpha amylase, catalytic region  32.17 
 
 		 657 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  32.82 
 
 		 1124 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  31.4 
 
 		 1130 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  31.4 
 
 		 1130 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  31.4 
 
 		 1130 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  24 
 
 		 715 aa  56.2  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3155  hypothetical protein  31.62 
 
 		 664 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  24.73 
 
 		 673 aa  55.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  32.48 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  24.22 
 
 		 736 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4301  alpha amylase, catalytic region  25.57 
 
 		 696 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4658  alpha amylase catalytic region  31.16 
 
 		 681 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  30.77 
 
 		 1082 aa  55.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 541 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  24.42 
 
 		 659 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  33.04 
 
 		 688 aa  54.7  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  22.57 
 
 		 624 aa  54.7  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3678  alpha amylase, catalytic region  32.17 
 
 		 659 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1466  alpha amylase, catalytic region  32.17 
 
 		 657 aa  55.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  25.99 
 
 		 666 aa  55.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  30.58 
 
 		 1130 aa  54.7  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36740  hypothetical protein  31.62 
 
 		 664 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.759208  normal  0.786637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  32.09 
 
 		 1037 aa  54.3  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  29.87 
 
 		 1126 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  23.88 
 
 		 766 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  32.48 
 
 		 671 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  30.83 
 
 		 682 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  24.11 
 
 		 704 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  23.88 
 
 		 715 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 652 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2089  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 		 679 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  29.06 
 
 		 664 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  29.5 
 
 		 544 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 		 716 aa  53.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  24.38 
 
 		 709 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  24.73 
 
 		 709 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  27.5 
 
 		 816 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  31.62 
 
 		 660 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  22.5 
 
 		 610 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>