50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2402 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  69.92 
 
 		 662 aa  901    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 641 aa  1296    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  69.98 
 
 		 660 aa  905    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  38.62 
 
 		 661 aa  433  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  41.3 
 
 		 655 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  37.98 
 
 		 660 aa  412  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  37.96 
 
 		 659 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  35.58 
 
 		 659 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  38.44 
 
 		 674 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  34.59 
 
 		 661 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  35.86 
 
 		 663 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  35.69 
 
 		 663 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  36.64 
 
 		 662 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  37.48 
 
 		 720 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  37.04 
 
 		 659 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  38.28 
 
 		 657 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  39.38 
 
 		 668 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  37.59 
 
 		 652 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  38.55 
 
 		 681 aa  365  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  32.01 
 
 		 712 aa  350  6e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  37.96 
 
 		 672 aa  346  7e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  35.23 
 
 		 657 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  35.23 
 
 		 657 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  31.85 
 
 		 672 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  34.78 
 
 		 678 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  33.33 
 
 		 686 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  34.62 
 
 		 678 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  36.08 
 
 		 675 aa  328  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  37.5 
 
 		 610 aa  324  3e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  31.8 
 
 		 672 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  33.33 
 
 		 687 aa  306  7e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  37.84 
 
 		 692 aa  297  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  30.66 
 
 		 651 aa  292  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  37.22 
 
 		 693 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  36.93 
 
 		 693 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.56 
 
 		 659 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  29.51 
 
 		 614 aa  260  6e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  30.05 
 
 		 611 aa  244  3.9999999999999997e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.28 
 
 		 565 aa  242  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  27.38 
 
 		 658 aa  216  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.37 
 
 		 651 aa  211  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.15 
 
 		 656 aa  209  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.22 
 
 		 1433 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  26.5 
 
 		 1526 aa  106  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  26.06 
 
 		 1537 aa  101  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  24.79 
 
 		 1593 aa  85.9  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.74 
 
 		 720 aa  49.7  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  25.33 
 
 		 758 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.13 
 
 		 734 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.27 
 
 		 741 aa  44.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>