77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2288 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  47.4 
 
 		 668 aa  640    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  48.86 
 
 		 663 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  57.34 
 
 		 659 aa  765    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 663 aa  1379    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  45.05 
 
 		 655 aa  565  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  46.65 
 
 		 661 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  45 
 
 		 672 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  45.15 
 
 		 672 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  43.91 
 
 		 660 aa  523  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  41.95 
 
 		 661 aa  494  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  40.61 
 
 		 674 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  39.58 
 
 		 659 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  39.3 
 
 		 659 aa  473  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  40.71 
 
 		 662 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  41.05 
 
 		 657 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  41.2 
 
 		 657 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  39.33 
 
 		 651 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  37.8 
 
 		 657 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  39.97 
 
 		 681 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  37.3 
 
 		 712 aa  442  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  38.02 
 
 		 675 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  37.91 
 
 		 672 aa  425  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  38.22 
 
 		 678 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  38.22 
 
 		 678 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  38.13 
 
 		 652 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  37.41 
 
 		 686 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  37.2 
 
 		 692 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  36.49 
 
 		 693 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  37.5 
 
 		 610 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.59 
 
 		 662 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  36.83 
 
 		 693 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  35.68 
 
 		 660 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  34.83 
 
 		 687 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  35.69 
 
 		 641 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  35.1 
 
 		 720 aa  364  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  33.8 
 
 		 611 aa  314  2.9999999999999996e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  33.54 
 
 		 614 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.99 
 
 		 659 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.19 
 
 		 651 aa  274  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.82 
 
 		 565 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.27 
 
 		 656 aa  251  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  27.35 
 
 		 658 aa  232  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.09 
 
 		 1433 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  25.33 
 
 		 1526 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  25.5 
 
 		 1537 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  22.86 
 
 		 1593 aa  97.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  25.3 
 
 		 727 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.88 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.72 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.53 
 
 		 751 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  23.98 
 
 		 758 aa  62  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.55 
 
 		 685 aa  60.8  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.28 
 
 		 723 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.27 
 
 		 685 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.37 
 
 		 760 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.13 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.87 
 
 		 735 aa  57.4  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.82 
 
 		 721 aa  56.6  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  23.31 
 
 		 729 aa  57  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.4 
 
 		 720 aa  57  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.09 
 
 		 741 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.36 
 
 		 733 aa  51.6  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.74 
 
 		 746 aa  51.2  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.44 
 
 		 708 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.7 
 
 		 682 aa  49.7  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.72 
 
 		 776 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.32 
 
 		 628 aa  48.5  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.72 
 
 		 718 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.72 
 
 		 740 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.72 
 
 		 741 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.75 
 
 		 729 aa  47.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  25.75 
 
 		 797 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.54 
 
 		 722 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  25.93 
 
 		 698 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.19 
 
 		 740 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.45 
 
 		 740 aa  44.3  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.66 
 
 		 720 aa  44.3  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>