44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0988 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 		 651 aa  1354    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  41.77 
 
 		 658 aa  502  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  34.36 
 
 		 660 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  32.38 
 
 		 720 aa  336  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  30.97 
 
 		 661 aa  317  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  32.33 
 
 		 659 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  32.34 
 
 		 659 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  33.54 
 
 		 659 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  32.08 
 
 		 674 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  33.08 
 
 		 655 aa  299  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  30.56 
 
 		 663 aa  297  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  31.05 
 
 		 668 aa  293  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  30.19 
 
 		 663 aa  281  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  30.88 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  31.25 
 
 		 652 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  29.64 
 
 		 712 aa  272  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  30.83 
 
 		 678 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  30.15 
 
 		 678 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  30.06 
 
 		 661 aa  264  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  31.07 
 
 		 662 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  29.28 
 
 		 681 aa  261  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  29.39 
 
 		 657 aa  257  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  29.71 
 
 		 675 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  30.01 
 
 		 686 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  29.24 
 
 		 657 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  30.09 
 
 		 657 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  28.85 
 
 		 672 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  28.53 
 
 		 672 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  29.62 
 
 		 692 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  29.58 
 
 		 693 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  29.17 
 
 		 693 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  28.89 
 
 		 672 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.68 
 
 		 656 aa  229  8e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  27.65 
 
 		 687 aa  228  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.89 
 
 		 662 aa  223  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  26.89 
 
 		 660 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  28.86 
 
 		 614 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  26.52 
 
 		 641 aa  219  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  27.46 
 
 		 611 aa  209  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.64 
 
 		 659 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.06 
 
 		 565 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  25.72 
 
 		 651 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.62 
 
 		 1433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.56 
 
 		 720 aa  44.3  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>