66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3715 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  60.61 
 
 		 675 aa  745    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  94.52 
 
 		 693 aa  1226    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  57.81 
 
 		 678 aa  756    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  94.24 
 
 		 693 aa  1222    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  57.21 
 
 		 678 aa  751    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 692 aa  1356    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  40.3 
 
 		 659 aa  458  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  40.83 
 
 		 661 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  37.48 
 
 		 661 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  41.44 
 
 		 663 aa  452  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  42.51 
 
 		 674 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  40.06 
 
 		 662 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  42.19 
 
 		 655 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  41.34 
 
 		 681 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  37.8 
 
 		 663 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  35.71 
 
 		 712 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  41.83 
 
 		 657 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  38.06 
 
 		 657 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  37.91 
 
 		 657 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  41.52 
 
 		 668 aa  415  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  33.38 
 
 		 672 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  37.59 
 
 		 659 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  38.03 
 
 		 659 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  32.89 
 
 		 672 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  36.9 
 
 		 660 aa  382  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  39.64 
 
 		 672 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  38.84 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  33.38 
 
 		 651 aa  347  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.24 
 
 		 659 aa  342  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  36.5 
 
 		 652 aa  341  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  35.87 
 
 		 687 aa  340  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  38.24 
 
 		 720 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  35.44 
 
 		 686 aa  333  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.54 
 
 		 662 aa  321  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  38.44 
 
 		 641 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  36.12 
 
 		 660 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  32.43 
 
 		 611 aa  284  4.0000000000000003e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  29.99 
 
 		 614 aa  282  1e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.33 
 
 		 651 aa  249  9e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  30.32 
 
 		 658 aa  246  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.2 
 
 		 565 aa  243  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.34 
 
 		 656 aa  209  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.43 
 
 		 1433 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  25.64 
 
 		 1537 aa  84  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  22.69 
 
 		 1526 aa  77.8  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  22.34 
 
 		 1593 aa  69.7  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.1 
 
 		 734 aa  63.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  25.44 
 
 		 737 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.38 
 
 		 721 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.88 
 
 		 741 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.28 
 
 		 718 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.68 
 
 		 720 aa  54.3  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.67 
 
 		 751 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.02 
 
 		 719 aa  52  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  26.81 
 
 		 712 aa  51.2  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.85 
 
 		 746 aa  50.8  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  25.88 
 
 		 727 aa  50.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.62 
 
 		 725 aa  50.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.82 
 
 		 708 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  26.47 
 
 		 729 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  24.88 
 
 		 706 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.57 
 
 		 700 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.45 
 
 		 726 aa  45.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.54 
 
 		 868 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.27 
 
 		 759 aa  45.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  25.91 
 
 		 715 aa  43.9  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>