12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000620 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000620  hypothetical protein  100 
 
 		 959 aa  1991    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1020  hypothetical protein  36.25 
 
 		 730 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1437  hypothetical protein  34.39 
 
 		 716 aa  206  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  34.23 
 
 		 883 aa  55.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  31.25 
 
 		 1432 aa  51.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0350  hypothetical protein  29.8 
 
 		 289 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.87 
 
 		 759 aa  48.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.71 
 
 		 757 aa  46.6  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  28.69 
 
 		 1472 aa  45.8  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  24.07 
 
 		 757 aa  45.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.73 
 
 		 740 aa  45.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  20.95 
 
 		 672 aa  44.7  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>