More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3868 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 752 aa  1558    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0138  alpha amylase, catalytic region  34.94 
 
 		 732 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0393  alpha amylase catalytic region  34.21 
 
 		 735 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0232636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1076  alpha amylase domain-containing protein  31.43 
 
 		 685 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.819574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  25.67 
 
 		 459 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  28.66 
 
 		 422 aa  115  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  28.04 
 
 		 422 aa  114  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  26.43 
 
 		 463 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  26.07 
 
 		 426 aa  109  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 467 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  23.27 
 
 		 426 aa  105  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 459 aa  104  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  28.26 
 
 		 524 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 479 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  21.8 
 
 		 434 aa  98.6  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 479 aa  97.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  30.54 
 
 		 600 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  25.68 
 
 		 687 aa  87  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3126  alpha-amylase family protein  32.93 
 
 		 604 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.524605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2993  Alpha amylase, catalytic region  32.93 
 
 		 604 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0819444  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4051  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.95 
 
 		 580 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1417  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.93 
 
 		 629 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1792  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.95 
 
 		 580 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.93 
 
 		 598 aa  79.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  23.63 
 
 		 587 aa  79.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  22.82 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  22.89 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3650  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.36 
 
 		 580 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.736771  normal  0.277493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  28.36 
 
 		 688 aa  77.8  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  32.93 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.53 
 
 		 640 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24900  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.33 
 
 		 601 aa  75.5  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.355935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2278  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.55 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380817  hitchhiker  0.00913073 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  25.49 
 
 		 728 aa  75.1  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1727  alpha amylase catalytic region  30.26 
 
 		 705 aa  75.1  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  21.93 
 
 		 588 aa  74.7  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  30.53 
 
 		 1146 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  31.05 
 
 		 1151 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  29.76 
 
 		 583 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.06 
 
 		 553 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.12 
 
 		 613 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  21.16 
 
 		 576 aa  73.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.12 
 
 		 613 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.76 
 
 		 583 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0936005  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  27.35 
 
 		 1133 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1823  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.76 
 
 		 580 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597034  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  27.35 
 
 		 1136 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  23.23 
 
 		 481 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  21.91 
 
 		 589 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  31 
 
 		 684 aa  70.5  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0990  alpha amylase all-beta  27.07 
 
 		 654 aa  70.1  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  25.45 
 
 		 1048 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.72 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  29.34 
 
 		 580 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  29.67 
 
 		 681 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  25.22 
 
 		 607 aa  70.1  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  29.34 
 
 		 580 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  28.5 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  24.68 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  29.34 
 
 		 580 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  29.34 
 
 		 580 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.34 
 
 		 634 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8140  alpha amylase catalytic region  28.97 
 
 		 728 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7549  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.99 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.73 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  21.35 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.12 
 
 		 636 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  20.44 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  20.63 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  22.75 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  19.48 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  22.51 
 
 		 752 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  22.99 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  28.81 
 
 		 715 aa  67  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1983  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.99 
 
 		 611 aa  67.4  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236935  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  30.22 
 
 		 541 aa  67  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.312205 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.67 
 
 		 561 aa  66.2  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  29.79 
 
 		 1124 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.51 
 
 		 736 aa  66.6  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.88 
 
 		 630 aa  66.6  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 		 533 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  19.42 
 
 		 586 aa  66.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  24.71 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  28.96 
 
 		 672 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  29.79 
 
 		 1124 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  26.76 
 
 		 1130 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  22.97 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  26.76 
 
 		 1130 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.94 
 
 		 608 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  30.41 
 
 		 592 aa  65.1  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  30.94 
 
 		 652 aa  65.1  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  29.03 
 
 		 716 aa  65.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.53 
 
 		 604 aa  65.1  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  25.6 
 
 		 1037 aa  65.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  29.05 
 
 		 701 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_003296  RS05186  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase protein  28.92 
 
 		 622 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256787  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  30.05 
 
 		 672 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4233  alpha amylase domain-containing protein  34.35 
 
 		 687 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  20.87 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  30.05 
 
 		 672 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>