More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4088 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  58.54 
 
 		 559 aa  673    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  59.43 
 
 		 559 aa  677    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  58.19 
 
 		 559 aa  667    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  65.19 
 
 		 556 aa  753    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  59.72 
 
 		 564 aa  690    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 563 aa  1157    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  58.19 
 
 		 559 aa  667    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  55.56 
 
 		 552 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  55.58 
 
 		 521 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  52.96 
 
 		 548 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  53.5 
 
 		 558 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  53.5 
 
 		 548 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  47.73 
 
 		 553 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  46.28 
 
 		 544 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  47.55 
 
 		 553 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  48.99 
 
 		 554 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  47.45 
 
 		 553 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  46.99 
 
 		 554 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  48.56 
 
 		 554 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  47.09 
 
 		 555 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  46.1 
 
 		 543 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  47.37 
 
 		 541 aa  512  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  46.1 
 
 		 554 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  46.35 
 
 		 540 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  44.44 
 
 		 579 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  42.7 
 
 		 570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  43.22 
 
 		 540 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  41.61 
 
 		 551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  39.72 
 
 		 556 aa  422  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  40.18 
 
 		 591 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  40.55 
 
 		 1131 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  40.36 
 
 		 1131 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  38.98 
 
 		 606 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  40.55 
 
 		 1131 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3106  trehalose synthase  41.82 
 
 		 535 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  40.55 
 
 		 1131 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  39.05 
 
 		 548 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  40.55 
 
 		 1131 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  40.55 
 
 		 1131 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  39.29 
 
 		 1152 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  38.45 
 
 		 1114 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  38.73 
 
 		 1108 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  39.09 
 
 		 1108 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  38.42 
 
 		 1121 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  38.23 
 
 		 682 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  39.6 
 
 		 1137 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  40.15 
 
 		 1136 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  40.51 
 
 		 1137 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  40.51 
 
 		 1137 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  39.78 
 
 		 1137 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  39 
 
 		 1061 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  40.51 
 
 		 1137 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  39.06 
 
 		 577 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  38.39 
 
 		 1100 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  38.38 
 
 		 1095 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  39.31 
 
 		 1113 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  39.09 
 
 		 1154 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  38.27 
 
 		 1121 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  38.22 
 
 		 1115 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  36.82 
 
 		 1123 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  38.42 
 
 		 1111 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  39.49 
 
 		 1106 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  38.02 
 
 		 572 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  39.6 
 
 		 1138 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  39.38 
 
 		 551 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  38.63 
 
 		 1093 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  38.34 
 
 		 1100 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  39.09 
 
 		 1154 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  38.94 
 
 		 601 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  38.35 
 
 		 556 aa  405  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  39.27 
 
 		 1106 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  39.27 
 
 		 1106 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  38.18 
 
 		 1160 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  38.5 
 
 		 1088 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  38.1 
 
 		 1102 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  38.29 
 
 		 1164 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  38.1 
 
 		 1102 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  38.45 
 
 		 1093 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  37.89 
 
 		 1099 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  38.29 
 
 		 1164 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  38.83 
 
 		 1099 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  39.78 
 
 		 616 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  38.5 
 
 		 1088 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  38.07 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  37.91 
 
 		 1098 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  39.06 
 
 		 1100 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  38.5 
 
 		 1092 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  38.28 
 
 		 1102 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  38.5 
 
 		 1088 aa  399  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  36.98 
 
 		 1104 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  38.25 
 
 		 1100 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  37.86 
 
 		 1100 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  37.91 
 
 		 574 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  38.17 
 
 		 1088 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  39.02 
 
 		 1108 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  37.99 
 
 		 1110 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  40.98 
 
 		 544 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  37.48 
 
 		 553 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  37.41 
 
 		 1100 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  39.56 
 
 		 1134 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>