77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0605 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  100 
 
 		 807 aa  1637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  44.19 
 
 		 891 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  51.84 
 
 		 550 aa  256  9e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  45.83 
 
 		 454 aa  210  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3120  S-layer domain protein  37.5 
 
 		 627 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  44.44 
 
 		 430 aa  190  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  40.09 
 
 		 651 aa  188  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  35.73 
 
 		 615 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  33 
 
 		 620 aa  183  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  34.19 
 
 		 620 aa  181  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  34.19 
 
 		 620 aa  180  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  47.96 
 
 		 330 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  39.23 
 
 		 613 aa  171  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 602 aa  169  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  46.2 
 
 		 502 aa  160  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  42.16 
 
 		 2495 aa  160  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  38.43 
 
 		 757 aa  154  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  37.67 
 
 		 512 aa  154  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  39.18 
 
 		 811 aa  153  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  39.47 
 
 		 592 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  32.05 
 
 		 753 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  43.6 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  40.13 
 
 		 750 aa  144  5e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 532 aa  135  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  36.28 
 
 		 324 aa  134  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  39.82 
 
 		 342 aa  130  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  35.9 
 
 		 573 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  35.77 
 
 		 552 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  34.29 
 
 		 434 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  33.8 
 
 		 817 aa  126  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  38.22 
 
 		 316 aa  124  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  43.1 
 
 		 440 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  42.14 
 
 		 302 aa  119  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  33.58 
 
 		 331 aa  118  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  36.78 
 
 		 1557 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 377 aa  101  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  32.94 
 
 		 465 aa  90.9  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  33.33 
 
 		 1131 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  37.09 
 
 		 1732 aa  90.9  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  33.33 
 
 		 1131 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  43.36 
 
 		 458 aa  89.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  31.1 
 
 		 2821 aa  86.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  31.64 
 
 		 697 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  32.1 
 
 		 578 aa  84.3  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  45.57 
 
 		 203 aa  83.6  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.62 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  32.61 
 
 		 1527 aa  81.6  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.69 
 
 		 762 aa  81.3  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  31.6 
 
 		 737 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  38.93 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.86 
 
 		 459 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  39.86 
 
 		 459 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.86 
 
 		 459 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  38.62 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0787  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosamidase  38.31 
 
 		 234 aa  79.3  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2837  S-layer protein  41.26 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122747  hitchhiker  0.0000000116253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.77 
 
 		 792 aa  78.2  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  41.26 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.16 
 
 		 843 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  32.34 
 
 		 1514 aa  75.5  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.79 
 
 		 350 aa  73.6  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.96 
 
 		 339 aa  73.2  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  30.53 
 
 		 1475 aa  72.4  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  30.46 
 
 		 890 aa  72  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  26.8 
 
 		 587 aa  68.9  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  26.2 
 
 		 589 aa  68.6  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1009 aa  59.3  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1002 aa  59.3  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1025 aa  58.9  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  40.68 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  29.73 
 
 		 1363 aa  57.4  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  27.72 
 
 		 420 aa  53.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0535  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  35.11 
 
 		 292 aa  48.5  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  25 
 
 		 474 aa  48.1  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.34 
 
 		 437 aa  47.8  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2771  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.63 
 
 		 307 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  28.98 
 
 		 184 aa  44.7  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>