68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14450 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  100 
 
 		 532 aa  1089    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.5 
 
 		 762 aa  195  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  44.31 
 
 		 651 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  34.49 
 
 		 613 aa  179  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  33.83 
 
 		 602 aa  178  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  41.9 
 
 		 330 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  41.16 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  30.85 
 
 		 512 aa  153  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  32.91 
 
 		 573 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  35.48 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  32.04 
 
 		 552 aa  143  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  43.01 
 
 		 478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  42.51 
 
 		 811 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  38.11 
 
 		 891 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  33.09 
 
 		 430 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  39.81 
 
 		 377 aa  137  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  47.73 
 
 		 502 aa  137  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  33.78 
 
 		 750 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  33.75 
 
 		 807 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  36.78 
 
 		 753 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  35.06 
 
 		 757 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  31.07 
 
 		 454 aa  134  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  34.26 
 
 		 434 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  37.41 
 
 		 316 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  39.13 
 
 		 2495 aa  130  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  33.55 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  34.58 
 
 		 592 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  40.23 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  33.88 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  36.41 
 
 		 817 aa  109  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  33.94 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  42.64 
 
 		 440 aa  99.8  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  29.14 
 
 		 1557 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  34.57 
 
 		 578 aa  91.7  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1454  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.56 
 
 		 156 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480002  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  28.9 
 
 		 1732 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  36.08 
 
 		 1131 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  36.08 
 
 		 1131 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  28.12 
 
 		 890 aa  77.4  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  48.75 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.6 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  34.03 
 
 		 697 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.88 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.88 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  36.8 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  30.29 
 
 		 737 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  24.92 
 
 		 1527 aa  72  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  25.96 
 
 		 2821 aa  65.1  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.29 
 
 		 339 aa  63.5  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  30.45 
 
 		 1514 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0727  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.16 
 
 		 653 aa  61.6  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  31.05 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.67 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  25.62 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  29.83 
 
 		 589 aa  57.4  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  28.88 
 
 		 1363 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1014  hypothetical protein  38.78 
 
 		 190 aa  53.5  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00318676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.97 
 
 		 218 aa  50.8  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0079  hypothetical protein  27.14 
 
 		 235 aa  50.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.36 
 
 		 171 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  24.49 
 
 		 1475 aa  48.5  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0535  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  45 
 
 		 292 aa  48.5  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  26.34 
 
 		 474 aa  48.9  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.36 
 
 		 177 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0464  hypothetical protein  28.99 
 
 		 228 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.767953 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  28.48 
 
 		 184 aa  45.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1684  hypothetical protein  40.74 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271172 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2050  NLP/P60 protein  24.46 
 
 		 696 aa  43.9  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.426387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>