91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05950 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  100 
 
 
753 aa  1540    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  36.7 
 
 
651 aa  401  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  49.44 
 
 
592 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  35.62 
 
 
602 aa  163  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  36.36 
 
 
613 aa  160  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  35.94 
 
 
550 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  32.05 
 
 
807 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  42.71 
 
 
750 aa  147  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  41.95 
 
 
502 aa  145  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  38.12 
 
 
330 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  31.49 
 
 
430 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  33.12 
 
 
757 aa  142  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  40.64 
 
 
811 aa  137  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  40.41 
 
 
454 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  40.19 
 
 
478 aa  135  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  32.76 
 
 
552 aa  134  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  36.78 
 
 
532 aa  134  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  39.66 
 
 
2495 aa  130  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  29.22 
 
 
573 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  33.33 
 
 
512 aa  125  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.15 
 
 
891 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  46.03 
 
 
440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  44.8 
 
 
302 aa  117  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  35.71 
 
 
434 aa  112  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  31.95 
 
 
324 aa  112  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  30.49 
 
 
331 aa  109  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  30.89 
 
 
377 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  27.5 
 
 
1557 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  35.87 
 
 
342 aa  101  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  30.56 
 
 
316 aa  96.3  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  32.2 
 
 
817 aa  94.7  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  41.38 
 
 
578 aa  93.6  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.32 
 
 
762 aa  93.2  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  38.56 
 
 
1732 aa  92.4  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  37.9 
 
 
271 aa  90.5  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  35.17 
 
 
1131 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  35.17 
 
 
1131 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  34.48 
 
 
697 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  30.07 
 
 
2821 aa  79.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  36.55 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  26.06 
 
 
1363 aa  77.4  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  35.71 
 
 
203 aa  75.1  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.36 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  26.62 
 
 
737 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  22.91 
 
 
1527 aa  63.5  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 
300 aa  63.9  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  23.79 
 
 
589 aa  62.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  25.35 
 
 
1514 aa  62.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  25.44 
 
 
1475 aa  60.1  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.53 
 
 
474 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  27.16 
 
 
532 aa  58.5  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.35 
 
 
268 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  23.03 
 
 
890 aa  52.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 
320 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  31.45 
 
 
420 aa  52.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.81 
 
 
860 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.09 
 
 
868 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  26.83 
 
 
300 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  30.28 
 
 
390 aa  49.3  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 
300 aa  48.9  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.04 
 
 
948 aa  48.9  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  26.15 
 
 
184 aa  48.9  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  26.83 
 
 
300 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  26.83 
 
 
300 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  32.23 
 
 
336 aa  48.5  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  31 
 
 
443 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1573  metallo-beta-lactamase family protein  26.28 
 
 
626 aa  48.9  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  24.32 
 
 
284 aa  48.5  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 
283 aa  48.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 
300 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 
300 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 
300 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  27.35 
 
 
300 aa  47.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 
300 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  27.35 
 
 
300 aa  47.8  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 
406 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.11 
 
 
747 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 
352 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
294 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  35.38 
 
 
348 aa  45.8  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  24.03 
 
 
1002 aa  45.8  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  24.03 
 
 
1009 aa  45.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.39 
 
 
399 aa  45.4  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 
281 aa  45.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.39 
 
 
399 aa  45.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  26.95 
 
 
587 aa  44.7  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
300 aa  44.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  22.66 
 
 
1025 aa  44.3  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 
318 aa  44.3  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
374 aa  44.3  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>