60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14460 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  100 
 
 
757 aa  1560    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0713  hypothetical protein  51.25 
 
 
549 aa  280  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.235142  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  38.91 
 
 
651 aa  186  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  35.76 
 
 
550 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  43.42 
 
 
817 aa  164  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  38.6 
 
 
602 aa  158  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  40 
 
 
613 aa  158  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  38.43 
 
 
807 aa  154  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  38.31 
 
 
430 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  41.7 
 
 
330 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  33.75 
 
 
753 aa  142  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  29.19 
 
 
1557 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  35.06 
 
 
532 aa  134  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  36.25 
 
 
512 aa  131  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  31.71 
 
 
454 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  37.04 
 
 
592 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  40 
 
 
502 aa  127  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  32.35 
 
 
552 aa  124  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  36.92 
 
 
2495 aa  123  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  33.22 
 
 
324 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  32.05 
 
 
573 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  29.98 
 
 
2821 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  35.97 
 
 
434 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  34.95 
 
 
331 aa  114  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.15 
 
 
891 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  31.9 
 
 
316 aa  112  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  34.5 
 
 
342 aa  111  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  38.86 
 
 
478 aa  110  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  33.19 
 
 
750 aa  109  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  39.01 
 
 
811 aa  108  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  30.67 
 
 
737 aa  92.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  28.77 
 
 
532 aa  91.3  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  35.36 
 
 
377 aa  89.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  44.35 
 
 
302 aa  88.2  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.98 
 
 
762 aa  88.2  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  38.06 
 
 
440 aa  87.8  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  29.38 
 
 
1475 aa  86.7  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  29.06 
 
 
1514 aa  85.5  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  29.6 
 
 
1131 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  29.6 
 
 
1131 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  28.85 
 
 
697 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  36.49 
 
 
465 aa  79.3  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  33.51 
 
 
1732 aa  74.7  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  26.96 
 
 
890 aa  74.3  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  50 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.38 
 
 
339 aa  70.1  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  25.75 
 
 
1527 aa  69.3  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.49 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  36.44 
 
 
578 aa  66.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  25.25 
 
 
1363 aa  59.7  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.33 
 
 
268 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  34.52 
 
 
271 aa  55.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  25.39 
 
 
587 aa  54.3  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  24.64 
 
 
589 aa  53.9  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23 
 
 
399 aa  51.6  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  29.44 
 
 
184 aa  51.2  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  25.19 
 
 
420 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.54 
 
 
399 aa  50.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0341  hypothetical protein  25.89 
 
 
335 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.209254 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  27.07 
 
 
1025 aa  44.3  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>