51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5584 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  100 
 
 
737 aa  1506    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5585  hypothetical protein  31.4 
 
 
399 aa  160  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  33.33 
 
 
1557 aa  99.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  30 
 
 
602 aa  94  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  30.67 
 
 
757 aa  92.4  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  27.87 
 
 
550 aa  87.8  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  37.41 
 
 
502 aa  84.3  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  26.4 
 
 
651 aa  84  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  31.6 
 
 
807 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  27.75 
 
 
613 aa  80.1  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  33.79 
 
 
811 aa  78.6  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  32 
 
 
750 aa  77  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  28.62 
 
 
331 aa  76.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  26.62 
 
 
753 aa  75.1  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  31.1 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.81 
 
 
762 aa  73.9  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  34.72 
 
 
1131 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  34.72 
 
 
1131 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  33.33 
 
 
2495 aa  72.8  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  30.29 
 
 
532 aa  71.2  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  27.41 
 
 
2821 aa  70.9  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  34.03 
 
 
697 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  29.47 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  32.39 
 
 
592 aa  68.6  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  29.73 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  26.35 
 
 
573 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  26.47 
 
 
454 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  34.04 
 
 
512 aa  66.6  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  31.58 
 
 
465 aa  66.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  24.56 
 
 
552 aa  66.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  37.07 
 
 
817 aa  65.1  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  28.64 
 
 
430 aa  64.7  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  33.65 
 
 
440 aa  63.9  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.5 
 
 
891 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  27.43 
 
 
377 aa  62.4  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  38.55 
 
 
271 aa  60.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
342 aa  60.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  28 
 
 
578 aa  60.1  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  39.29 
 
 
203 aa  56.6  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  26.53 
 
 
1527 aa  57  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  26.47 
 
 
302 aa  57.4  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  28.57 
 
 
316 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  26.69 
 
 
1514 aa  53.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  43.21 
 
 
184 aa  52.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  23.02 
 
 
434 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  27.39 
 
 
589 aa  49.3  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.65 
 
 
339 aa  48.1  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  30.57 
 
 
1732 aa  47  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  39.47 
 
 
1363 aa  45.8  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  24.72 
 
 
890 aa  45.4  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  27.92 
 
 
1475 aa  44.7  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>