95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07880 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  100 
 
 		 651 aa  1333    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  36.77 
 
 		 753 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  47.53 
 
 		 613 aa  207  7e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  48.33 
 
 		 330 aa  198  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  51.5 
 
 		 502 aa  197  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  38.62 
 
 		 550 aa  193  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  40.84 
 
 		 602 aa  193  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  40.09 
 
 		 807 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 757 aa  187  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  40.09 
 
 		 430 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  44.31 
 
 		 532 aa  180  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  37.17 
 
 		 454 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  48.35 
 
 		 2495 aa  175  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  42.98 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  38.54 
 
 		 324 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  47.19 
 
 		 811 aa  167  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  36.36 
 
 		 552 aa  168  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  48.63 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  42.5 
 
 		 342 aa  164  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  34.18 
 
 		 573 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  39.58 
 
 		 316 aa  162  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  41.79 
 
 		 750 aa  162  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  38.31 
 
 		 331 aa  157  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  36.55 
 
 		 434 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  43.92 
 
 		 592 aa  153  8.999999999999999e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.53 
 
 		 891 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  41.4 
 
 		 817 aa  144  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  47.8 
 
 		 302 aa  133  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  46.81 
 
 		 440 aa  132  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 377 aa  127  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1557 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.56 
 
 		 762 aa  110  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  39.05 
 
 		 578 aa  110  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  40.99 
 
 		 1732 aa  107  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  57.14 
 
 		 203 aa  97.8  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  32.61 
 
 		 1131 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  31.09 
 
 		 2821 aa  96.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  32.61 
 
 		 1131 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  33.15 
 
 		 697 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1573  metallo-beta-lactamase family protein  24.7 
 
 		 626 aa  94.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  29.45 
 
 		 465 aa  93.6  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  27.24 
 
 		 1514 aa  90.5  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.15 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  26.4 
 
 		 737 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  27.64 
 
 		 890 aa  80.1  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  25.38 
 
 		 589 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  24.23 
 
 		 1475 aa  79.3  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  23.83 
 
 		 1527 aa  77  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  24.18 
 
 		 1363 aa  71.6  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1002 aa  68.2  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  25.26 
 
 		 587 aa  68.2  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  36.45 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1025 aa  67.8  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1009 aa  67.8  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  25.96 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 421 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  27.73 
 
 		 420 aa  60.1  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  23.98 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 320 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 284 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.21 
 
 		 814 aa  54.7  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.26 
 
 		 682 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.43 
 
 		 268 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.47 
 
 		 514 aa  52.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  31.39 
 
 		 184 aa  52  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  23.53 
 
 		 295 aa  52  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  26.46 
 
 		 291 aa  51.6  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.74 
 
 		 749 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  26.67 
 
 		 502 aa  51.2  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  26.32 
 
 		 443 aa  51.2  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  24.63 
 
 		 437 aa  50.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 283 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.43 
 
 		 794 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  23.23 
 
 		 286 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.32 
 
 		 399 aa  48.9  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 		 292 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  25.4 
 
 		 291 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  23.41 
 
 		 352 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.41 
 
 		 399 aa  47.4  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.4 
 
 		 818 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  26.41 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0535  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  50.91 
 
 		 292 aa  47.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6746  hypothetical protein  33.71 
 
 		 429 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 451 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  26.13 
 
 		 348 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 		 281 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  31.58 
 
 		 795 aa  45.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3366  hypothetical protein  29.79 
 
 		 226 aa  45.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.204348  hitchhiker  0.000467396 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  24.8 
 
 		 336 aa  44.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.66 
 
 		 747 aa  44.3  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  24.24 
 
 		 454 aa  44.3  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  23.41 
 
 		 390 aa  44.3  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>