64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1413 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  100 
 
 
437 aa  882    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  83.51 
 
 
1009 aa  331  1e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  83.51 
 
 
1002 aa  331  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  83.51 
 
 
1025 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0224  hypothetical protein  40.14 
 
 
239 aa  88.6  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  30.73 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  30.58 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  30.1 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  27.59 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  29.2 
 
 
348 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.41 
 
 
348 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.44 
 
 
348 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  29.9 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  25.74 
 
 
320 aa  60.5  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  25.79 
 
 
592 aa  60.1  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  24.88 
 
 
327 aa  58.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0160  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.74 
 
 
487 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648956  unclonable  1.03661e-27 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 
496 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  26.21 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.96 
 
 
292 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  27.36 
 
 
266 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  27.48 
 
 
491 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  25.51 
 
 
282 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 
628 aa  53.5  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  25 
 
 
574 aa  53.5  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  30.94 
 
 
502 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  24.64 
 
 
265 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  27.86 
 
 
257 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0695  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.27 
 
 
310 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0632  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.27 
 
 
310 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  24.63 
 
 
651 aa  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  26.6 
 
 
662 aa  49.3  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  24.37 
 
 
267 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  24.17 
 
 
265 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  26.81 
 
 
245 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  25.13 
 
 
261 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  22.39 
 
 
260 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  28.34 
 
 
807 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  23.38 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  25.42 
 
 
251 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  25 
 
 
297 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.49 
 
 
811 aa  46.2  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  23.46 
 
 
245 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  23.46 
 
 
245 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  26.63 
 
 
602 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  42.19 
 
 
1131 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  23.46 
 
 
245 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  42.19 
 
 
1131 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  26.11 
 
 
550 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  30.65 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  25.76 
 
 
340 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1394  endolysin  25 
 
 
269 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000700106 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3576  glycoside hydrolase family protein  21.58 
 
 
268 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0170489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  27.32 
 
 
262 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0678  endolysin  22.31 
 
 
269 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.320423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  24.12 
 
 
252 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2931  glycoside hydrolase family protein  20.7 
 
 
273 aa  43.9  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000727334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2255  endolysin  22.31 
 
 
269 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  24.87 
 
 
320 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4364  glycoside hydrolase family 25  22.87 
 
 
278 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  26.2 
 
 
935 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  32.61 
 
 
1527 aa  43.1  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1628  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.04 
 
 
363 aa  43.1  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000128844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>