137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2875 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  100 
 
 
265 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  97.74 
 
 
265 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  73.76 
 
 
261 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  68.46 
 
 
267 aa  397  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  53.49 
 
 
263 aa  285  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  55.41 
 
 
355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  53.81 
 
 
345 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  53.81 
 
 
348 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  53.12 
 
 
333 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  52.34 
 
 
334 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  49.45 
 
 
277 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  48.85 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  48.85 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  53.33 
 
 
363 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  53.33 
 
 
329 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  51.38 
 
 
260 aa  261  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  54.75 
 
 
263 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 
263 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  52.38 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  51.97 
 
 
292 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  46.18 
 
 
248 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
335 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  44.66 
 
 
282 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  47.64 
 
 
282 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 
283 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  45.71 
 
 
283 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  47.78 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  48.31 
 
 
283 aa  215  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  36.14 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  37.56 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  37.56 
 
 
245 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  37.56 
 
 
245 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 
272 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  33.46 
 
 
272 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  33.09 
 
 
272 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 
272 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  32.72 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  32.35 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  34.91 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  35.38 
 
 
249 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  31.99 
 
 
272 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  31.99 
 
 
272 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  36.57 
 
 
268 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  31.99 
 
 
272 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  34.65 
 
 
255 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  35.78 
 
 
340 aa  132  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  38.54 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 
279 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  35.05 
 
 
233 aa  122  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  34.29 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  36.04 
 
 
259 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  30.86 
 
 
574 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  34 
 
 
252 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  34.76 
 
 
496 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  35.75 
 
 
399 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  27.14 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  30.91 
 
 
313 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  28.99 
 
 
342 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  27.8 
 
 
342 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  34.38 
 
 
241 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0144  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  27.32 
 
 
342 aa  92  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
348 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  30.43 
 
 
935 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  27.32 
 
 
342 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  32.5 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  33.5 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  30.92 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  32.18 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0764  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 
251 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.295441  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 
628 aa  89.4  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  29.41 
 
 
348 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.95 
 
 
348 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.95 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  32.18 
 
 
262 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  32.09 
 
 
380 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 
829 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.52 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  30.47 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  28.36 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.7 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  27.72 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  30.33 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  32.87 
 
 
216 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  30.29 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.8 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  28.21 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  30.35 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  29.72 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1311  autolytic lysozyme, putative  30.19 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  27.59 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0460  prophage LambdaBa04, glycosyl hydrolase family protein 25  28.64 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.186644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0485  prophage lambdaba04, glycosyl hydrolase family protein 25  28.64 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06405  secreted glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14420)  29.1 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0292849 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.77 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4364  glycoside hydrolase family 25  31.12 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1721  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0604  endolysin  29.74 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 
337 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0206  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.47 
 
 
669 aa  65.1  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>