195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3364 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  93.1 
 
 
348 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  92.24 
 
 
348 aa  664    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  92.24 
 
 
348 aa  666    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
348 aa  706    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  41.31 
 
 
574 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  31.59 
 
 
342 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2077  cell wall hydrolase/autolysin  58.91 
 
 
333 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  30.75 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2236  sporulation-specific N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  57.36 
 
 
328 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3088  sporulation-specific N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  58.14 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  hitchhiker  9.85648e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  29.6 
 
 
342 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  28.78 
 
 
342 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  34.58 
 
 
321 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  40 
 
 
251 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1311  autolytic lysozyme, putative  33.64 
 
 
317 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23164  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  37.89 
 
 
252 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5853  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.21 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2684  prophage LambdaBa01, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 2  42.33 
 
 
311 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  35.41 
 
 
399 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3412  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.48 
 
 
310 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000169904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2690  L-alanyl-D-glutamate peptidase  42.96 
 
 
281 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  38.54 
 
 
291 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3490  prophage LambdaBa01, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family protein 2  42.48 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000347114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3767  prophage lambdaba01, n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase family protein 2  42.48 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000174527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2637  prophage LambdaBa01, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 2  41.1 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2620  L-alanyl-D-glutamate peptidase  42.96 
 
 
281 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  35.27 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5325  cell wall hydrolase/autolysin  44.96 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  36.72 
 
 
245 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  32.26 
 
 
277 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  32.26 
 
 
277 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  31.72 
 
 
277 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  31.22 
 
 
340 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2143  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 
331 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  37.22 
 
 
240 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  34.67 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 
263 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  33.33 
 
 
283 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
283 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  32.08 
 
 
380 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  32.8 
 
 
241 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  30.61 
 
 
248 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  31.58 
 
 
272 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  32.06 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3407  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.24 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000173531  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  32.65 
 
 
283 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  31.58 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  31.41 
 
 
272 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 
272 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  31.63 
 
 
272 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 
261 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  31.1 
 
 
272 aa  93.2  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  31.63 
 
 
282 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  32.29 
 
 
263 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  32.29 
 
 
263 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  31.52 
 
 
255 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  31.46 
 
 
262 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  29.41 
 
 
265 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  31.63 
 
 
282 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  30.48 
 
 
267 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  30.18 
 
 
935 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  29.13 
 
 
282 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  30.85 
 
 
829 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 
355 aa  89.4  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 
335 aa  89.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  30.89 
 
 
272 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  30.89 
 
 
272 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.02 
 
 
266 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  29.41 
 
 
265 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  32.79 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  30.34 
 
 
216 aa  87.8  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  30 
 
 
329 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 
334 aa  85.9  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 
333 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  28.49 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  29.03 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.38 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  29.44 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2931  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000727334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0678  endolysin  28.87 
 
 
269 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.320423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2255  endolysin  28.87 
 
 
269 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2615  glycosy hydrolase family protein  28.87 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2805  glycosy hydrolase family protein  28.87 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2813  putative glycosyl hydrolase, family 25  28.87 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000152496 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2532  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.38 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00849711  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4364  glycoside hydrolase family 25  26.79 
 
 
278 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2869  endolysin  29.09 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00807006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0604  endolysin  28.72 
 
 
266 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.22 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  28.96 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2462  endolysin  28.87 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.568862  normal  0.603316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2848  U32 family peptidase  29.09 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0264815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3024  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.96 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2833  endolysin  28.87 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  28.8 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 
628 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>