109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6875 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  66.38 
 
 
287 aa  314  8e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  54.76 
 
 
282 aa  255  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  56.34 
 
 
250 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  53.82 
 
 
323 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  53 
 
 
829 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  52.25 
 
 
935 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  51.69 
 
 
216 aa  207  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  50 
 
 
252 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  51.47 
 
 
241 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  49.54 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  50.42 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  50.24 
 
 
216 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  52.07 
 
 
380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  46.18 
 
 
291 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  47 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06405  secreted glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14420)  40.51 
 
 
245 aa  158  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0292849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  39.15 
 
 
399 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  34.66 
 
 
496 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  32.13 
 
 
574 aa  103  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  34.4 
 
 
245 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  34.27 
 
 
348 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.43 
 
 
348 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.97 
 
 
348 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  34.17 
 
 
248 aa  96.3  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  33.5 
 
 
355 aa  95.9  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 
333 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  31.16 
 
 
348 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  29.6 
 
 
294 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  31.16 
 
 
345 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 
348 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  28.74 
 
 
329 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  35.1 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  32.38 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  33.81 
 
 
240 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  28.74 
 
 
363 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 
334 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 
283 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  31.4 
 
 
283 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  30.7 
 
 
282 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  31.9 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  32.71 
 
 
263 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  32.71 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  32.99 
 
 
342 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  30.95 
 
 
283 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  28.17 
 
 
272 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  28.17 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  33.15 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  30.81 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  37.95 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  32.16 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  27.82 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  29.78 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  29.78 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  31.55 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  32.49 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  27.46 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  27.46 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  27.46 
 
 
272 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  31.98 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  31.43 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  31.47 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  27.82 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  30.81 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  27.11 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 
263 aa  79  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  32.74 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  32.75 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  28.5 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 
628 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  29.67 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  35.05 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  35.05 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  35.05 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  28.65 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3550  glycoside hydrolase family 25  30.6 
 
 
372 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0276847  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  26.46 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  27.86 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  28.57 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  26.98 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1135  phage lysin-like lysozyme M1  30.45 
 
 
411 aa  64.7  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.38 
 
 
331 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  30.26 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 
292 aa  63.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0206  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.6 
 
 
669 aa  62  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5643  glycoside hydrolase family 25  28.64 
 
 
335 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.7 
 
 
327 aa  60.1  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0160  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.77 
 
 
487 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648956  unclonable  1.03661e-27 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6525  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 
375 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00161443  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0485  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 
406 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 
337 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  31.36 
 
 
331 aa  52.8  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  25.81 
 
 
321 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1311  autolytic lysozyme, putative  25.12 
 
 
317 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  26.6 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>