34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0224 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0224  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  487  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  40.94 
 
 		 437 aa  87.8  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0695  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  35.19 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0632  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  35.19 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.17 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.57 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  27.82 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 		 348 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0160  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  33.04 
 
 		 487 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648956  unclonable  1.03661e-27 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  27.86 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  30.43 
 
 		 380 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  30.84 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  30.43 
 
 		 342 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  25.71 
 
 		 574 aa  48.9  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  38.64 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3550  glycoside hydrolase family 25  27.61 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0276847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  25.74 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0206  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  35.9 
 
 		 669 aa  46.2  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  29.35 
 
 		 342 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  27.96 
 
 		 342 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  29.35 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  37.31 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  29.32 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  33.87 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  31.4 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.58 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  37.5 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  38.71 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  32.31 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  32.31 
 
 		 345 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 		 496 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 628 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  29.07 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>