128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3414 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  100 
 
 
252 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  66.26 
 
 
251 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  66.83 
 
 
291 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  48.15 
 
 
250 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  50 
 
 
262 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  47.51 
 
 
216 aa  203  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  46.51 
 
 
287 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  48.77 
 
 
216 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  41.44 
 
 
282 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  42.79 
 
 
241 aa  174  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  39.3 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  39.64 
 
 
935 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  41.85 
 
 
380 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 
829 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  42.2 
 
 
319 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  39.71 
 
 
266 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06405  secreted glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14420)  37.76 
 
 
245 aa  146  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0292849 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  37.14 
 
 
574 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  38.08 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  38.95 
 
 
348 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.79 
 
 
348 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  33.82 
 
 
342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.42 
 
 
348 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  37.8 
 
 
248 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  37.89 
 
 
348 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  37.28 
 
 
399 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  34.03 
 
 
342 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  34.03 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  37.4 
 
 
496 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  36.54 
 
 
272 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  33.51 
 
 
342 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  36.54 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  36.54 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  36.54 
 
 
272 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  36.06 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  35.58 
 
 
272 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  36.71 
 
 
340 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 
282 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  35.1 
 
 
272 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  35.58 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  35.58 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  37.5 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  35.96 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  35.96 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  37 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 
333 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  37.5 
 
 
282 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  38.31 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  34.83 
 
 
355 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  34.16 
 
 
329 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  34.33 
 
 
334 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  34.16 
 
 
363 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 
277 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  39.5 
 
 
292 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 
263 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  29.86 
 
 
279 aa  102  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  34 
 
 
265 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  34 
 
 
235 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  33.5 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  34.95 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  36.36 
 
 
297 aa  98.6  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  36.23 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  32.5 
 
 
345 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  32.5 
 
 
348 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  31.16 
 
 
207 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  31.25 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  28.03 
 
 
245 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  28.03 
 
 
245 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  27.62 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 
263 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  35.71 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  32.67 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  32.71 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  30.29 
 
 
249 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  31.98 
 
 
249 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  31.77 
 
 
320 aa  89  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  30.35 
 
 
628 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  33.17 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  31.48 
 
 
286 aa  85.9  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.58 
 
 
327 aa  85.5  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  30.92 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  29.38 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  29.47 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  27.65 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0206  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.56 
 
 
669 aa  73.9  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  32.58 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  34.02 
 
 
491 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1311  autolytic lysozyme, putative  27.05 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23164  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  27.64 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.27 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  29.81 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5643  glycoside hydrolase family 25  28.04 
 
 
335 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.31 
 
 
331 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3550  glycoside hydrolase family 25  27.35 
 
 
372 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0276847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2848  U32 family peptidase  25.25 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0264815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2869  endolysin  24.75 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00807006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>