124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1545 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  100 
 
 		 272 aa  566  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 272 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  98.16 
 
 		 272 aa  557  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  98.16 
 
 		 272 aa  558  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  98.53 
 
 		 272 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  98.16 
 
 		 272 aa  558  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  98.16 
 
 		 272 aa  557  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  97.43 
 
 		 272 aa  553  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  97.06 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  49.33 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  45.07 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  43.14 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  42.64 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  40.69 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  39.04 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 333 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  38.67 
 
 		 355 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  36.32 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  39.57 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  36.32 
 
 		 345 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  39.13 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  33.09 
 
 		 265 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  32.35 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  36 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  38.14 
 
 		 248 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  35.29 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  38.07 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  35.37 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  33.01 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  35.37 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  35.91 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  33.71 
 
 		 292 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  34.5 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  32.11 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  33.64 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  32.11 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  35.02 
 
 		 574 aa  125  9e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  36.97 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  38.39 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  36.87 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  36.87 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  35.69 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  38.68 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  36.54 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  34.67 
 
 		 249 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  35.03 
 
 		 342 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  37.09 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  35.03 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  32.86 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  32.52 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  36.32 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  36.32 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  33.83 
 
 		 233 aa  112  9e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  34.22 
 
 		 496 aa  112  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  32.47 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  32.04 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  33.18 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  34.62 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.46 
 
 		 348 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  31.41 
 
 		 348 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.94 
 
 		 348 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  33.66 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  30.3 
 
 		 935 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  34.36 
 
 		 294 aa  95.5  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  29.78 
 
 		 313 aa  95.5  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  32.23 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  32.34 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.67 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  30.53 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 829 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  31.1 
 
 		 216 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 		 628 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  30.09 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  29.06 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.43 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  30.09 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  29.54 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.17 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  26.98 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  28.24 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  27.35 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  28.12 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1311  autolytic lysozyme, putative  27.96 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23164  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.85 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.28 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.11 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0524  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  19.16 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00922637  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0206  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.69 
 
 		 669 aa  62.8  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0764  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.295441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  29.13 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  27.67 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.37 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  28.14 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  34.35 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  27 
 
 		 592 aa  55.8  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>