123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5362 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
282 aa  587  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  90.78 
 
 
282 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  80.21 
 
 
283 aa  477  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  80.21 
 
 
283 aa  477  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  83.9 
 
 
283 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  84.21 
 
 
294 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  54.88 
 
 
248 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  56.94 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  50.45 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
333 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  52.21 
 
 
263 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  50.93 
 
 
363 aa  230  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  50.93 
 
 
329 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  46.46 
 
 
265 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  47.27 
 
 
345 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  47.73 
 
 
348 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  51.33 
 
 
263 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  50.88 
 
 
263 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  44.66 
 
 
265 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  47.95 
 
 
355 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  45.31 
 
 
277 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  44.11 
 
 
261 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  44.57 
 
 
263 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  43.53 
 
 
260 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  44.44 
 
 
277 aa  215  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  42.39 
 
 
267 aa  215  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  44.59 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  48.66 
 
 
292 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  36.41 
 
 
235 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  38 
 
 
249 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  38.76 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  33.79 
 
 
245 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  33.79 
 
 
245 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  33.79 
 
 
245 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  35.8 
 
 
255 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  36.65 
 
 
259 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  33.19 
 
 
233 aa  124  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  33.98 
 
 
279 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  34.26 
 
 
268 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  40.43 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  38.57 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  38.1 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  38.1 
 
 
272 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  37.62 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  37.14 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  36.55 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  35.5 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  37.62 
 
 
272 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  37.62 
 
 
272 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  37.62 
 
 
272 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  35.62 
 
 
252 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  30.7 
 
 
574 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  33.33 
 
 
286 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  35.25 
 
 
251 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  33.96 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  29.5 
 
 
342 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  30.2 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  29.5 
 
 
342 aa  95.9  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  35.47 
 
 
399 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  35.61 
 
 
496 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.67 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0764  glycoside hydrolase family protein  30.73 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.295441  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  31.63 
 
 
348 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  32.14 
 
 
348 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  33.33 
 
 
245 aa  92.4  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  35 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.12 
 
 
348 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 
628 aa  89.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  30.46 
 
 
342 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  29.9 
 
 
207 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.82 
 
 
348 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  32.51 
 
 
287 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  29.95 
 
 
935 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 
829 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  31.86 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  27.92 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  29.7 
 
 
491 aa  82  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0144  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 
231 aa  82  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  33.53 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  30.73 
 
 
282 aa  79  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.35 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  28.57 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  29.23 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  31.84 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  28.71 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.93 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  33.55 
 
 
216 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  30.73 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.96 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  30.88 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  32.59 
 
 
319 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6332  glycoside hydrolase family protein  34.86 
 
 
354 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.171538  normal  0.121489 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  24.88 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6525  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 
375 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00161443  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  25.89 
 
 
592 aa  55.8  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.25 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1721  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0563  glycoside hydrolase family 25  25.89 
 
 
364 aa  53.5  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0159511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>