122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3899 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 283 aa  591  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  100 
 
 		 283 aa  591  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  97.53 
 
 		 283 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  80.21 
 
 		 282 aa  477  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  81.63 
 
 		 282 aa  471  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  82.31 
 
 		 294 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  54.01 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  55 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  49.51 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  49.19 
 
 		 263 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  50.66 
 
 		 263 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  48.86 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  48.79 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  48.6 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  48.13 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  45.33 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  45.27 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  45.33 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  45 
 
 		 345 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  45.45 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  45.5 
 
 		 277 aa  218  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  42.51 
 
 		 267 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  45.71 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  47.87 
 
 		 261 aa  215  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  43.19 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  45.66 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  42.23 
 
 		 263 aa  212  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  46.64 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  37.86 
 
 		 235 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  37.86 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  32.27 
 
 		 245 aa  141  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  32.27 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  32.27 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  37.44 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  38.65 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  35.18 
 
 		 233 aa  130  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  34.29 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  31.78 
 
 		 268 aa  122  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  32.39 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  37.97 
 
 		 294 aa  118  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  35.47 
 
 		 340 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  36.79 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  36.32 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  36.32 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  37.5 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  36.32 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  34.47 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  35.85 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  35.38 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  37.62 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  35.85 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  35.38 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  35.38 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0764  glycoside hydrolase family protein  34.2 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.295441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  34.01 
 
 		 574 aa  105  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  35.18 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  31.82 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  32.5 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  31.82 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  35.47 
 
 		 245 aa  99.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  35.78 
 
 		 496 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  32.09 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 348 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  33.17 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  31.07 
 
 		 935 aa  95.5  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  30.7 
 
 		 829 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  35.61 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  31.77 
 
 		 348 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  31.16 
 
 		 342 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.36 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.46 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  32.67 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.75 
 
 		 348 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  31.4 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  30 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0144  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 		 231 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  31.09 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 		 628 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  31.31 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  27.5 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  33.67 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  29.85 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  32.12 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  29.72 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  28.93 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.655151 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  32.02 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  28.21 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.69 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.44 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.36 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1311  autolytic lysozyme, putative  28.64 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  29.9 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  26.11 
 
 		 592 aa  62  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  24.88 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  25.59 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  24.87 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.9 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0206  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  24.54 
 
 		 669 aa  53.9  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0568  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  21.33 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0253119 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>