134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2097 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  100 
 
 
348 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  91.09 
 
 
345 aa  630  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  69.86 
 
 
333 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  63.64 
 
 
355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  63.11 
 
 
334 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  65.28 
 
 
363 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  66.77 
 
 
329 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  49.8 
 
 
265 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  53.81 
 
 
265 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  51.13 
 
 
267 aa  262  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  51.12 
 
 
261 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  51.77 
 
 
263 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  50.66 
 
 
260 aa  248  9e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  52.94 
 
 
263 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  47.26 
 
 
277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  50 
 
 
248 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  52.04 
 
 
263 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  46.84 
 
 
277 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  46.84 
 
 
277 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  51.82 
 
 
263 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  51.58 
 
 
292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  48.51 
 
 
335 aa  228  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  47.73 
 
 
282 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  48.04 
 
 
294 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  47.73 
 
 
282 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 
283 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  45.45 
 
 
283 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  45 
 
 
283 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  39.02 
 
 
235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  40.65 
 
 
245 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  40.19 
 
 
245 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  40.19 
 
 
245 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  39.81 
 
 
257 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  37.18 
 
 
272 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  36.74 
 
 
249 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  36.32 
 
 
272 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  36.32 
 
 
272 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  36.32 
 
 
272 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  35.9 
 
 
272 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  36.32 
 
 
272 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  35.9 
 
 
272 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  35.9 
 
 
272 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  35.9 
 
 
272 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  34.88 
 
 
249 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  36.19 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  38.03 
 
 
268 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  37.14 
 
 
255 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  35.18 
 
 
233 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  40.39 
 
 
259 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  36.84 
 
 
294 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  32.24 
 
 
574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  34.17 
 
 
342 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  33.67 
 
 
342 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  34.5 
 
 
496 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  33.67 
 
 
342 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0764  glycoside hydrolase family protein  32.11 
 
 
251 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.295441  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  31.07 
 
 
286 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  31.22 
 
 
399 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  33.16 
 
 
342 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  32.5 
 
 
252 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.96 
 
 
266 aa  96.7  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  29.55 
 
 
313 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  31.68 
 
 
245 aa  93.2  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  29.7 
 
 
291 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  31.78 
 
 
380 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  31.16 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 
829 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  29.6 
 
 
935 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0524  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.57 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00922637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  29.5 
 
 
251 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  29.63 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.03 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.09 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.57 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  29.41 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  28.86 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0144  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  30.58 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 
628 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.51 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.93 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  30.24 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  31.09 
 
 
491 aa  76.3  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  28.14 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  25.87 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  30.05 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06405  secreted glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14420)  26.37 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0292849 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0460  prophage LambdaBa04, glycosyl hydrolase family protein 25  26.83 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.186644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0485  prophage lambdaba04, glycosyl hydrolase family protein 25  26.83 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  28.28 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29 
 
 
278 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0604  endolysin  26.47 
 
 
266 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4364  glycoside hydrolase family 25  26.83 
 
 
278 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2931  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 
273 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000727334  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  26.17 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.06 
 
 
331 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488385 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>