71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0764 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0764  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.295441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0144  glycoside hydrolase family protein  44.33 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  34.2 
 
 		 277 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  34.2 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 		 355 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  32.64 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  32.31 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  36.08 
 
 		 263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  28.87 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  34.36 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  33.16 
 
 		 334 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  33.16 
 
 		 329 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  34.2 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  34.2 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  32.11 
 
 		 348 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  32.63 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  31.58 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  31.72 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  33.16 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  33.68 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  33.68 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  28.45 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  30.15 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  31.96 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  30.57 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  30.73 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  31.41 
 
 		 265 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  28 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  28 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  28 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  30.37 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  32.83 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  28.8 
 
 		 267 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 335 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.8 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  30.41 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  27.41 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  24.89 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  28.87 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  26.24 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  25.74 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  25.74 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  25.74 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  25.74 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0524  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.41 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00922637  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  22.22 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  25.25 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  23.47 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  24.75 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  24.75 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  22.99 
 
 		 574 aa  56.2  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  24.48 
 
 		 348 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  23.83 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  23.84 
 
 		 348 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 		 348 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.86 
 
 		 348 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  40.85 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0407  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.96 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  33.33 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  23.78 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  22.95 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  24.34 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  26.47 
 
 		 342 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  34.21 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 		 399 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  26.47 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  22.28 
 
 		 628 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  24.06 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>