69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0144 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0144  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0764  glycoside hydrolase family protein  44.33 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.295441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  25.35 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  24.34 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  24.34 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  29.77 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  23.89 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  30.9 
 
 		 263 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  28.65 
 
 		 265 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 333 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 		 294 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  29.41 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  28.65 
 
 		 265 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  30.15 
 
 		 277 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  30.15 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 		 355 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  30 
 
 		 329 aa  88.6  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 334 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  27.6 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 		 283 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  30.11 
 
 		 283 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  29.41 
 
 		 363 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  27.86 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  31.52 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  29.03 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.64 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  26.49 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  28.88 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  25.95 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  26.78 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  27.04 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0524  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00922637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  24.59 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.73 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.73 
 
 		 348 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  23.43 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  20.83 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  24.82 
 
 		 342 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  23.27 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  21.69 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  20.79 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  22.33 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  21.56 
 
 		 574 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  23.86 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  23.35 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0407  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.42 
 
 		 297 aa  48.9  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  22.84 
 
 		 272 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  23.35 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  22.84 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  22.84 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  22.84 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  23.48 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  34.48 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  22.34 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 399 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  21.97 
 
 		 628 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  21.98 
 
 		 279 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 		 496 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>