105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2674 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
829 aa  1692    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  56.4 
 
 
935 aa  944    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  47.29 
 
 
287 aa  222  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  49.54 
 
 
216 aa  217  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  49.32 
 
 
282 aa  215  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  53 
 
 
262 aa  215  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  48.83 
 
 
250 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  47.47 
 
 
241 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  45.37 
 
 
216 aa  193  9e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  48.89 
 
 
380 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  46.08 
 
 
323 aa  187  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  39.26 
 
 
319 aa  174  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  40.43 
 
 
266 aa  169  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  39.15 
 
 
252 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  35.74 
 
 
291 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  38.03 
 
 
251 aa  140  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.1 
 
 
905 aa  131  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06405  secreted glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14420)  33.01 
 
 
245 aa  125  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0292849 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  32.56 
 
 
793 aa  125  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  35.32 
 
 
496 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 
399 aa  114  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  32.74 
 
 
245 aa  107  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0423  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.06 
 
 
874 aa  101  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  32.11 
 
 
574 aa  100  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.37 
 
 
348 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  30.7 
 
 
283 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  26.22 
 
 
345 aa  95.1  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  30.7 
 
 
283 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  30.36 
 
 
277 aa  95.1  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  31.84 
 
 
348 aa  94.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  31.22 
 
 
277 aa  93.6  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  27.03 
 
 
363 aa  93.6  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  31.53 
 
 
277 aa  93.6  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  26.78 
 
 
329 aa  92.8  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 
334 aa  92.8  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  30.57 
 
 
283 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.34 
 
 
348 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  27.59 
 
 
348 aa  90.9  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 
294 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 
355 aa  89.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  31.44 
 
 
272 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  30.85 
 
 
348 aa  89.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  31.44 
 
 
272 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 
335 aa  89  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  31 
 
 
272 aa  88.2  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 
272 aa  88.2  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 
333 aa  87.8  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  30.4 
 
 
263 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  30 
 
 
313 aa  86.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  30.88 
 
 
265 aa  86.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  31.17 
 
 
282 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  30.57 
 
 
272 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  30.57 
 
 
272 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  30.88 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  30.13 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  29.96 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  30.13 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
263 aa  84  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
263 aa  84  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 
282 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  30.13 
 
 
272 aa  84  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  29.26 
 
 
340 aa  82.8  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  28.63 
 
 
255 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  33.56 
 
 
294 aa  82  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  30.41 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  30.24 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  27.18 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  25.49 
 
 
245 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  25.49 
 
 
245 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  25.49 
 
 
245 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 
263 aa  76.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  26.75 
 
 
342 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 
261 aa  76.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  25.22 
 
 
257 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3238  hypothetical protein  31.52 
 
 
296 aa  73.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.29 
 
 
327 aa  73.6  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  26.39 
 
 
235 aa  73.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  25.93 
 
 
342 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 
279 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  29.9 
 
 
240 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  27.86 
 
 
342 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  28.25 
 
 
259 aa  69.7  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 
292 aa  67.4  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  27.43 
 
 
286 aa  67  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 
207 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  25.48 
 
 
249 aa  60.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 
628 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  28.38 
 
 
331 aa  60.1  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  41.77 
 
 
297 aa  58.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  25 
 
 
249 aa  57.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.24 
 
 
278 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  27.09 
 
 
320 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  26.44 
 
 
266 aa  54.7  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  23.32 
 
 
233 aa  54.3  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  26.64 
 
 
491 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  26.09 
 
 
320 aa  53.9  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  26.76 
 
 
321 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3550  glycoside hydrolase family 25  26.4 
 
 
372 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0276847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>