121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0691 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  100 
 
 
248 aa  511  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  75 
 
 
335 aa  357  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  54.88 
 
 
282 aa  278  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  54.01 
 
 
283 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  54.01 
 
 
283 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  58.74 
 
 
294 aa  275  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  58.74 
 
 
283 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  54.39 
 
 
282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  53.77 
 
 
334 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  53.3 
 
 
363 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  53.3 
 
 
329 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  51.43 
 
 
333 aa  250  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  55.09 
 
 
267 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  46.95 
 
 
265 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  55.4 
 
 
277 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  46.18 
 
 
265 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
263 aa  245  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  50 
 
 
345 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  50 
 
 
348 aa  241  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  52.8 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  51.64 
 
 
277 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  51.64 
 
 
277 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  50.72 
 
 
355 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  53.14 
 
 
260 aa  231  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  52.66 
 
 
263 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  51.21 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  51.21 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  50.72 
 
 
292 aa  205  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  36.86 
 
 
235 aa  174  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  40.2 
 
 
233 aa  162  6e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  34.43 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  34.43 
 
 
245 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  34.43 
 
 
245 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  41.09 
 
 
249 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  42.93 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  42.44 
 
 
259 aa  148  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  38.61 
 
 
249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  39.19 
 
 
340 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  38.6 
 
 
272 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  37.62 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  36.84 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  38.14 
 
 
272 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  38.14 
 
 
272 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  38.6 
 
 
272 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  38.14 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  38.14 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  37.67 
 
 
272 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  37.67 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  37.67 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  39.89 
 
 
294 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  35.75 
 
 
279 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  40.49 
 
 
252 aa  121  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  29.88 
 
 
574 aa  115  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  35.63 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  32.24 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  34.25 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0764  glycoside hydrolase family protein  31.66 
 
 
251 aa  101  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.295441  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  34.83 
 
 
348 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  35.83 
 
 
496 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  35.78 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  30.65 
 
 
207 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  32.2 
 
 
342 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  34.17 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32 
 
 
348 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0144  glycoside hydrolase family protein  30.21 
 
 
231 aa  95.9  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 
348 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.84 
 
 
348 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  35.55 
 
 
399 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  31.71 
 
 
342 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  31.22 
 
 
342 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 
628 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  32.89 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  30.19 
 
 
342 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  33.5 
 
 
287 aa  89  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.31 
 
 
266 aa  85.1  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  28.82 
 
 
935 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  29.96 
 
 
829 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  31 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  33.82 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  31.73 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.15 
 
 
327 aa  82  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  31.03 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  29.57 
 
 
380 aa  78.6  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  31.65 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.96 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.61 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  28.17 
 
 
323 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.9 
 
 
319 aa  72  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  28.04 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.24 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  28.35 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  28.43 
 
 
592 aa  69.7  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  31.19 
 
 
662 aa  64.7  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  29.76 
 
 
297 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0206  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.31 
 
 
669 aa  61.6  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  29.29 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 
337 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6332  glycoside hydrolase family protein  38.6 
 
 
354 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.171538  normal  0.121489 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  24.42 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>