108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6874 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  100 
 
 
282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  56.25 
 
 
262 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  57.28 
 
 
287 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  51.83 
 
 
250 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  47.98 
 
 
935 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  49.54 
 
 
829 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  49.51 
 
 
241 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  46.78 
 
 
323 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  46.12 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  41.44 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  43.9 
 
 
216 aa  181  9.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  44.17 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  41.18 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  48.33 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  40.83 
 
 
251 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  42.65 
 
 
266 aa  158  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06405  secreted glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14420)  37.84 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0292849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  32.33 
 
 
245 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  33.08 
 
 
496 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  30.77 
 
 
574 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  34.56 
 
 
399 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  30.93 
 
 
348 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.89 
 
 
348 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  31.8 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.58 
 
 
348 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  30.83 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  31.34 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  33.65 
 
 
335 aa  92.4  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  33 
 
 
355 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 
333 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  30.92 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  30.73 
 
 
265 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  30.8 
 
 
263 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 
348 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  30.48 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  30.48 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  31.22 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  30.84 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.46 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  31.73 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  28.66 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  30.38 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  30.38 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  28.86 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  28.36 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  35.12 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  27.95 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  29.19 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  29.85 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  29.85 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  29.54 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  29.85 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  29.54 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  31.22 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  26.73 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  26.73 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  26.73 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  28.57 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  27.95 
 
 
342 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  28.69 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  28.69 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  30.23 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  29.11 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  28.69 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  28.04 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  29.37 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  31.34 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  31.6 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  24.29 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 
628 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  26.05 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  29.21 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 
337 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.04 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  27.36 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  32.17 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  24.42 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  30.21 
 
 
249 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  27.41 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  29.41 
 
 
266 aa  58.9  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3550  glycoside hydrolase family 25  35.78 
 
 
372 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0276847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  28.99 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1311  autolytic lysozyme, putative  27.88 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23164  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1135  phage lysin-like lysozyme M1  26.88 
 
 
411 aa  55.5  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  29.77 
 
 
331 aa  53.5  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.38 
 
 
437 aa  53.1  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.31 
 
 
331 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0224  hypothetical protein  28.57 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  23.65 
 
 
233 aa  50.8  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5643  glycoside hydrolase family 25  29.45 
 
 
335 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>