126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3565 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
263 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  99.62 
 
 
263 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  90.11 
 
 
263 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  60.43 
 
 
277 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  55.81 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  55.43 
 
 
277 aa  304  9.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  56.81 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  52.92 
 
 
292 aa  265  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  50.77 
 
 
265 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  50.77 
 
 
265 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  50.19 
 
 
261 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  50.95 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  50.2 
 
 
355 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  51.12 
 
 
267 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  53.6 
 
 
334 aa  242  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  50.64 
 
 
333 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  52.04 
 
 
348 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  51.58 
 
 
345 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  47.58 
 
 
329 aa  238  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  47.18 
 
 
363 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  48.13 
 
 
283 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  48.13 
 
 
283 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  51.98 
 
 
283 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  50.88 
 
 
282 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  51.1 
 
 
282 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  51.21 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  48.44 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  49.51 
 
 
335 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  38.42 
 
 
235 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  41.06 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  41.35 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  36.57 
 
 
245 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  37.26 
 
 
245 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  37.26 
 
 
245 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  41 
 
 
249 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  41.88 
 
 
294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  36.23 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 
279 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  33.83 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  34.24 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  34.63 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  34.78 
 
 
272 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  37.68 
 
 
259 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  34.24 
 
 
272 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  33.08 
 
 
272 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  33.08 
 
 
272 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  35.41 
 
 
257 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  33.08 
 
 
272 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  34.12 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  34.18 
 
 
233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  33.17 
 
 
574 aa  102  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0764  glycoside hydrolase family protein  33.68 
 
 
251 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.295441  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  32.87 
 
 
313 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 
399 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  35.21 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.12 
 
 
348 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  32.12 
 
 
348 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  32.29 
 
 
348 aa  92.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  37.22 
 
 
496 aa  92  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  35.21 
 
 
380 aa  92  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.12 
 
 
348 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  32.35 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  36.06 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0144  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 
231 aa  89.4  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  29.63 
 
 
286 aa  89  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  35.75 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  30.67 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  35.1 
 
 
241 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  32.71 
 
 
262 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  34.13 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
829 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  27.72 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  28.29 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 
628 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  29.84 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  30 
 
 
935 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.95 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  28.64 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  31.44 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  26.52 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  30.1 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  30.09 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  32.52 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.24 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.88 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  25.67 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  32.17 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  27.36 
 
 
207 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0524  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.52 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00922637  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  29.93 
 
 
216 aa  63.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  27.62 
 
 
331 aa  62.8  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  30.14 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1721  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06405  secreted glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14420)  28.19 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0292849 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0206  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.1 
 
 
669 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  37.23 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.25 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.78 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  24.77 
 
 
321 aa  52.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>