111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0555 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  100 
 
 		 380 aa  764    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  49.57 
 
 		 935 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  52.07 
 
 		 262 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  46.01 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  50.45 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  48.89 
 
 		 829 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  49.1 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  49.77 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  47.22 
 
 		 241 aa  192  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  45.21 
 
 		 216 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  44.5 
 
 		 216 aa  186  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  40.86 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  41.85 
 
 		 252 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  44.95 
 
 		 266 aa  167  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  42.04 
 
 		 251 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06405  secreted glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14420)  41.09 
 
 		 245 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0292849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  37.73 
 
 		 291 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  38.91 
 
 		 245 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  38.42 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  33.78 
 
 		 574 aa  102  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  32.89 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  34.42 
 
 		 333 aa  99.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  35.02 
 
 		 334 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.02 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  33.62 
 
 		 272 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  31.8 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.55 
 
 		 348 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  32.76 
 
 		 272 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  34.39 
 
 		 277 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  32.76 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  32.76 
 
 		 272 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  32.09 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  32.76 
 
 		 272 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0122  hypothetical protein  37.65 
 
 		 452 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  32.61 
 
 		 255 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  31.63 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  32.11 
 
 		 340 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  31.78 
 
 		 345 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  31.78 
 
 		 348 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  32.58 
 
 		 267 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  35.68 
 
 		 277 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  35.21 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  35.68 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  31.9 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  35.21 
 
 		 263 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  31.9 
 
 		 272 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  31.47 
 
 		 272 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  31.47 
 
 		 272 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  31.8 
 
 		 265 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  31.19 
 
 		 313 aa  87  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  30.54 
 
 		 283 aa  87  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  30.54 
 
 		 283 aa  87  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  32.09 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  31.09 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  34.85 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  32.86 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  30.85 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  31.09 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  30.54 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4969  hypothetical protein  47.47 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  30.59 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.44 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  29.57 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  30.73 
 
 		 245 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  30.73 
 
 		 245 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  30.73 
 
 		 245 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  27.83 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  27.98 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  31.66 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  32.47 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  30.88 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  29.21 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 		 261 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  30.96 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  30.41 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  34.44 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3550  glycoside hydrolase family 25  31.76 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0276847  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  25.13 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  27.23 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1311  autolytic lysozyme, putative  29.52 
 
 		 317 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6419  hypothetical protein  35.58 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.405354  hitchhiker  0.00880371 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.14 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  33.33 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  31.09 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  27.68 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 628 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  32.17 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6902  hypothetical protein  38.46 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  27.83 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.67 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0485  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0224  hypothetical protein  32.14 
 
 		 239 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3711  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 		 337 aa  53.1  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  27.14 
 
 		 320 aa  52.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.655151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>