102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13500 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  100 
 
 
327 aa  684    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  42.22 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  48.42 
 
 
278 aa  212  9e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  47.95 
 
 
266 aa  202  8e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  42.72 
 
 
628 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  37.95 
 
 
491 aa  123  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  37.88 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  35.29 
 
 
592 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  30.46 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  30.46 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  29.8 
 
 
277 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  33.5 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  33 
 
 
342 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  33 
 
 
342 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  35.29 
 
 
662 aa  88.6  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  32.51 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 
263 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  31 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  29.58 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.64 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  30.15 
 
 
248 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  29.26 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  28.86 
 
 
251 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  30.43 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  29.59 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  29.59 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  30.61 
 
 
574 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  29.44 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  30.43 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  30.35 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  28.85 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  30.43 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  29.7 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  26.46 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  29.7 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  30.35 
 
 
272 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  29.95 
 
 
272 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  29.44 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  28.35 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  28.43 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  31.03 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  29.95 
 
 
272 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  28.93 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  29.95 
 
 
272 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  26.67 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  30.04 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  29.23 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  28.44 
 
 
249 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 
829 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  28.78 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  28.95 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0563  glycoside hydrolase family 25  29.5 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0159511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  27.69 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  27.69 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  27.09 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  30.56 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  21.74 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  27.84 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  27.18 
 
 
935 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 
496 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  27.04 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1311  autolytic lysozyme, putative  25.66 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23164  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  24.27 
 
 
267 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  27.69 
 
 
250 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  26.04 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  26.46 
 
 
262 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  26.63 
 
 
380 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  25.97 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  25.97 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  24.34 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  24.88 
 
 
437 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  25.63 
 
 
245 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 
216 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  25.71 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.51 
 
 
266 aa  53.9  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  25.89 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  25.41 
 
 
216 aa  52.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.79 
 
 
287 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1721  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  24.29 
 
 
245 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1250  hypothetical protein  25.94 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0611744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  23.56 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  24.53 
 
 
240 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1394  endolysin  24.08 
 
 
269 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000700106 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  21.74 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0678  endolysin  24.87 
 
 
269 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.320423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>