62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0524 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0524  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  100 
 
 
245 aa  500  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00922637  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0407  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  34.39 
 
 
297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  28.57 
 
 
345 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  28.57 
 
 
348 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0568  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.01 
 
 
238 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0253119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 
334 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  28.12 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  27.15 
 
 
329 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  28.19 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  24.65 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  24.65 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  19.81 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  23.24 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  22.78 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  22.78 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  22.78 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  23.19 
 
 
292 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  22.47 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  23.56 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  19.16 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  19.16 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  18.87 
 
 
272 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  19.34 
 
 
272 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0764  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.295441  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  18.22 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  21.74 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  22.46 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0144  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
231 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  18.87 
 
 
272 aa  59.7  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  18.69 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  18.69 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  23.6 
 
 
257 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  21.74 
 
 
265 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  24.34 
 
 
342 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  23.5 
 
 
268 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 
294 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  19.85 
 
 
340 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  22.73 
 
 
279 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  22.54 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  21.91 
 
 
342 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  22.56 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  20.1 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  20.8 
 
 
282 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  26.04 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  17.34 
 
 
294 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  23.33 
 
 
342 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  29.1 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  21.77 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  20.79 
 
 
342 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  25.93 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  21.93 
 
 
283 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  23.58 
 
 
283 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 
283 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  25.28 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  26.04 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.28 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  28.57 
 
 
216 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>