79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0206 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0206  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  100 
 
 
669 aa  1318    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1485  hypothetical protein  42.23 
 
 
773 aa  299  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0293306  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  44.61 
 
 
331 aa  154  7e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1135  phage lysin-like lysozyme M1  39.13 
 
 
411 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  33.97 
 
 
574 aa  103  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  30.56 
 
 
252 aa  73.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 
355 aa  72.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  30.1 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  29.63 
 
 
251 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.4 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.54 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 
333 aa  66.6  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  25.47 
 
 
265 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  30.39 
 
 
291 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  32.16 
 
 
348 aa  64.7  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 
334 aa  64.3  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  25 
 
 
265 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  28.24 
 
 
272 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 
272 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  28.24 
 
 
272 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  28.69 
 
 
272 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  27.05 
 
 
342 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  30.6 
 
 
262 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  27.57 
 
 
272 aa  61.6  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  28.24 
 
 
272 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  31.28 
 
 
240 aa  62  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  25.82 
 
 
267 aa  61.6  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  26.51 
 
 
277 aa  61.2  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  26.51 
 
 
277 aa  61.2  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
277 aa  61.6  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  27.31 
 
 
248 aa  61.2  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  28.17 
 
 
272 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  25.23 
 
 
329 aa  60.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  24.88 
 
 
345 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  29.51 
 
 
496 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  24.77 
 
 
363 aa  59.7  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 
399 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  30.9 
 
 
250 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  27.21 
 
 
272 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  27.21 
 
 
272 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  24.88 
 
 
348 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1734  N-acetylmuramidase  43.28 
 
 
208 aa  58.5  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  25.35 
 
 
261 aa  58.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
263 aa  57.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  22.75 
 
 
294 aa  57  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  25.98 
 
 
342 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  25.96 
 
 
935 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 
263 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 
263 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.88 
 
 
287 aa  55.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  25.98 
 
 
342 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 
335 aa  54.3  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  24.54 
 
 
283 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  25.49 
 
 
342 aa  53.9  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  24.54 
 
 
283 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  24.54 
 
 
283 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  25.45 
 
 
263 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  24.34 
 
 
235 aa  53.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  23.22 
 
 
282 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  22.97 
 
 
340 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  23.22 
 
 
282 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  24.1 
 
 
268 aa  50.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  26.92 
 
 
245 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 
279 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 
829 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  30.07 
 
 
216 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 
260 aa  48.9  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  24.77 
 
 
241 aa  48.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.6 
 
 
292 aa  47.8  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  25.25 
 
 
320 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.13 
 
 
319 aa  47  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0224  hypothetical protein  35.9 
 
 
239 aa  46.6  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0160  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.3 
 
 
487 aa  46.6  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648956  unclonable  1.03661e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  22.9 
 
 
245 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 
292 aa  45.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  22.9 
 
 
245 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  22.9 
 
 
245 aa  45.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1628  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.04 
 
 
363 aa  44.3  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000128844  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  27.32 
 
 
216 aa  43.9  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>