88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3576 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3576  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
268 aa  558  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0170489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0678  endolysin  89.93 
 
 
269 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.320423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2255  endolysin  89.93 
 
 
269 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1394  endolysin  77.99 
 
 
269 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000700106 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2931  glycoside hydrolase family protein  73.16 
 
 
273 aa  401  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000727334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0460  prophage LambdaBa04, glycosyl hydrolase family protein 25  70.19 
 
 
265 aa  391  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.186644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0485  prophage lambdaba04, glycosyl hydrolase family protein 25  70.19 
 
 
265 aa  391  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0604  endolysin  70.19 
 
 
266 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2848  U32 family peptidase  67.27 
 
 
276 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0264815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2869  endolysin  66.91 
 
 
276 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00807006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2833  endolysin  67.27 
 
 
276 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2462  endolysin  66.18 
 
 
276 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.568862  normal  0.603316 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2564  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  65.17 
 
 
268 aa  367  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0333494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2532  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  65.54 
 
 
268 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00849711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2615  glycosy hydrolase family protein  65.17 
 
 
268 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2813  putative glycosyl hydrolase, family 25  65.17 
 
 
268 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000152496 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2805  glycosy hydrolase family protein  65.17 
 
 
268 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4364  glycoside hydrolase family 25  88.04 
 
 
278 aa  357  9e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3024  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  60.57 
 
 
332 aa  305  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2143  glycoside hydrolase family protein  70.1 
 
 
331 aa  305  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2300  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  70.1 
 
 
332 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1721  glycoside hydrolase family protein  48.52 
 
 
270 aa  261  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0741  endolysin, putative  35 
 
 
315 aa  113  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1724  cell wall hydrolase/autolysin  68.06 
 
 
257 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0475505  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0755  U32 family peptidase  29.56 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0043  lysozyme domain-containing protein  29.17 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  29.23 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.21 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.69 
 
 
348 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  28.21 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1250  hypothetical protein  26.42 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0611744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 
628 aa  62.4  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  27.45 
 
 
342 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  24.88 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  27.45 
 
 
342 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  27.08 
 
 
342 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  26.6 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2849  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.42 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000907792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2870  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.91 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00570311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  26.11 
 
 
348 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2834  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.91 
 
 
244 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  27.18 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  27.18 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  29.35 
 
 
297 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2461  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.91 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 
333 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 
355 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  24.87 
 
 
252 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  25.52 
 
 
342 aa  52  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  26.94 
 
 
329 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
334 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  27.84 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
399 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  26.94 
 
 
363 aa  49.7  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  24.23 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  22.22 
 
 
277 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  22.22 
 
 
277 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.38 
 
 
292 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  23.56 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  24.62 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 
294 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  22.7 
 
 
279 aa  45.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  22.96 
 
 
574 aa  45.8  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  23.56 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  25.37 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  23.68 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  23.68 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  21.58 
 
 
437 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  26.84 
 
 
491 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  27.55 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  23.68 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  27.98 
 
 
592 aa  43.9  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  24.24 
 
 
662 aa  43.9  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  25.38 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  25.5 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  25.63 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 
496 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  23.16 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  26.29 
 
 
245 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  26.29 
 
 
245 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  26.29 
 
 
245 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 
292 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  24.24 
 
 
331 aa  42  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>