29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0741 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0741  endolysin, putative  100 
 
 
315 aa  645    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0755  U32 family peptidase  67.38 
 
 
282 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1250  hypothetical protein  38.16 
 
 
267 aa  223  4e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0611744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2143  glycoside hydrolase family protein  34.65 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3576  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0170489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2564  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.01 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0333494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2532  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.01 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00849711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3024  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.01 
 
 
332 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2848  U32 family peptidase  33.82 
 
 
276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0264815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2805  glycosy hydrolase family protein  34.01 
 
 
268 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2813  putative glycosyl hydrolase, family 25  34.01 
 
 
268 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000152496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2300  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.5 
 
 
332 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2615  glycosy hydrolase family protein  34.01 
 
 
268 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2869  endolysin  34.33 
 
 
276 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00807006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2931  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 
273 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000727334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1394  endolysin  34.52 
 
 
269 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000700106 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0460  prophage LambdaBa04, glycosyl hydrolase family protein 25  33.5 
 
 
265 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.186644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0485  prophage lambdaba04, glycosyl hydrolase family protein 25  33.5 
 
 
265 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2833  endolysin  34.52 
 
 
276 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0604  endolysin  32.5 
 
 
266 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0678  endolysin  33.67 
 
 
269 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.320423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2255  endolysin  33.67 
 
 
269 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4364  glycoside hydrolase family 25  33 
 
 
278 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2462  endolysin  32.99 
 
 
276 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.568862  normal  0.603316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1721  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0563  glycoside hydrolase family 25  30.81 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0159511  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  25.27 
 
 
662 aa  58.5  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0043  lysozyme domain-containing protein  27.54 
 
 
269 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.27 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>