65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2143 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2143  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
331 aa  678    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2300  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  76.81 
 
 
332 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3024  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  77.11 
 
 
332 aa  537  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2564  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  81.38 
 
 
268 aa  329  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0333494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2532  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  81.38 
 
 
268 aa  328  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00849711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2813  putative glycosyl hydrolase, family 25  81.38 
 
 
268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000152496 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2615  glycosy hydrolase family protein  81.38 
 
 
268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2805  glycosy hydrolase family protein  81.38 
 
 
268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1394  endolysin  77.32 
 
 
269 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000700106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2462  endolysin  65.45 
 
 
276 aa  322  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.568862  normal  0.603316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2848  U32 family peptidase  69.81 
 
 
276 aa  319  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0264815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2869  endolysin  70.28 
 
 
276 aa  318  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00807006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0604  endolysin  74.74 
 
 
266 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2833  endolysin  64.61 
 
 
276 aa  315  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0485  prophage lambdaba04, glycosyl hydrolase family protein 25  75.53 
 
 
265 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0460  prophage LambdaBa04, glycosyl hydrolase family protein 25  75.53 
 
 
265 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.186644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4364  glycoside hydrolase family 25  61.72 
 
 
278 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2255  endolysin  65.49 
 
 
269 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0678  endolysin  65.49 
 
 
269 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.320423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2931  glycoside hydrolase family protein  67.14 
 
 
273 aa  306  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000727334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3576  glycoside hydrolase family protein  70.1 
 
 
268 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0170489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1721  glycoside hydrolase family protein  51.87 
 
 
270 aa  222  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1510  antigen  56.12 
 
 
329 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0667541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1511  cell wall endopeptidase, family M23/M37  57.14 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0605287 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0741  endolysin, putative  34.65 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0755  U32 family peptidase  34.33 
 
 
282 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  25.44 
 
 
348 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.88 
 
 
348 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 
348 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.96 
 
 
348 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0043  lysozyme domain-containing protein  29.17 
 
 
269 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1250  hypothetical protein  30.39 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0611744  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  29.17 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  28.65 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  29.17 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  27.04 
 
 
342 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  27.8 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  25.87 
 
 
265 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  26.37 
 
 
265 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 
261 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  25.62 
 
 
345 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  25.62 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 
355 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 
628 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 
260 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  21.88 
 
 
574 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  24.53 
 
 
233 aa  46.6  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  32.39 
 
 
592 aa  46.6  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  25.37 
 
 
662 aa  46.2  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  22.38 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  26.73 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  26.24 
 
 
329 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  23.62 
 
 
277 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  24.87 
 
 
255 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  23.62 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  23 
 
 
252 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  28.36 
 
 
496 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  27.96 
 
 
491 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 
263 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  24.48 
 
 
278 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  24.87 
 
 
320 aa  42.4  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.655151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>