32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1250 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1250  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  555  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0611744  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0755  U32 family peptidase  46.23 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0741  endolysin, putative  45.67 
 
 
315 aa  219  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0460  prophage LambdaBa04, glycosyl hydrolase family protein 25  30.5 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.186644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0485  prophage lambdaba04, glycosyl hydrolase family protein 25  30.5 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0604  endolysin  30.57 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4364  glycoside hydrolase family 25  30.54 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2564  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.8 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0333494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2931  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000727334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2532  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.8 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00849711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2143  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2615  glycosy hydrolase family protein  29.8 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2813  putative glycosyl hydrolase, family 25  29.8 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000152496 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2805  glycosy hydrolase family protein  29.8 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0678  endolysin  28.65 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.320423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2255  endolysin  28.65 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2300  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.43 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3024  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.08 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2833  endolysin  28.12 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2869  endolysin  27.6 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00807006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3576  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0170489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2848  U32 family peptidase  27.6 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0264815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1394  endolysin  32.24 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000700106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2462  endolysin  26.56 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.568862  normal  0.603316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1721  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0563  glycoside hydrolase family 25  26.7 
 
 
364 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0159511  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.94 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 
628 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1311  autolytic lysozyme, putative  24.07 
 
 
317 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23164  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  24.55 
 
 
662 aa  42.7  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1521  glycosy hydrolase family protein  24.77 
 
 
321 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0932253  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  23.29 
 
 
265 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>