20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1628 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1628  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  100 
 
 		 363 aa  738    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000128844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0160  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  39.17 
 
 		 487 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648956  unclonable  1.03661e-27 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0632  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  36.44 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0695  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  36.44 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  32.05 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.78 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 		 628 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  30.46 
 
 		 266 aa  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  27.43 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 496 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  28.29 
 
 		 491 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  27.83 
 
 		 574 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0206  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.04 
 
 		 669 aa  48.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  26.36 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.38 
 
 		 437 aa  46.2  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.85 
 
 		 327 aa  46.2  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  27.27 
 
 		 592 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  30.3 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  28.9 
 
 		 251 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>