67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1411 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  100 
 
 
1002 aa  2031    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  75.56 
 
 
1025 aa  1312    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  72.41 
 
 
1009 aa  1461    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  83.51 
 
 
437 aa  332  3e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4270  levansucrase  27.36 
 
 
527 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169981  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3698  levansucrase  26.9 
 
 
526 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3247  levansucrase  27.36 
 
 
527 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.36332  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4171  levansucrase  26.9 
 
 
526 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0733922  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4096  levansucrase  27.36 
 
 
527 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0480075  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3405  Beta-fructofuranosidase  27.01 
 
 
473 aa  105  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.83791 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1872  levansucrase  27.44 
 
 
509 aa  103  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  29.79 
 
 
532 aa  103  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0964  levansucrase  26.3 
 
 
385 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6047  levansucrase  27.1 
 
 
531 aa  100  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000164133  hitchhiker  0.00000266409 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1984  levansucrase  26.2 
 
 
494 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2102  levansucrase precursor  26.2 
 
 
521 aa  99.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0735  levansucrase  26.44 
 
 
494 aa  99.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0822  levansucrase  26.2 
 
 
494 aa  99.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1010  levansucrase  26.2 
 
 
494 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450168  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0714  levansucrase  26.2 
 
 
494 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0466  levansucrase  26.2 
 
 
521 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  28.21 
 
 
1363 aa  98.6  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1938  Levansucrase  25.97 
 
 
436 aa  97.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6116  levansucrase  28.42 
 
 
531 aa  96.3  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.116097 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2488  glycoside hydrolase family 68  24.7 
 
 
471 aa  92  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4097  Beta-fructofuranosidase  27.86 
 
 
451 aa  89.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2103  levansucrase  25.06 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962759  decreased coverage  0.00209256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0405  levansucrase  27.19 
 
 
522 aa  85.1  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  32.23 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.58 
 
 
514 aa  84  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2305  levansucrase  26.48 
 
 
415 aa  82  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.18 
 
 
474 aa  82  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0032  levansucrase  26.79 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1453  levansucrase  26.48 
 
 
431 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0754  levansucrase  26.71 
 
 
431 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1531  Levansucrase  26.7 
 
 
584 aa  79.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.515752  normal  0.219322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0616  Levansucrase  25.39 
 
 
532 aa  73.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2021  levansucrase  24.03 
 
 
534 aa  73.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00566302  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  27.66 
 
 
651 aa  67.8  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  26.49 
 
 
602 aa  63.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  34.5 
 
 
184 aa  63.2  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  32.96 
 
 
2495 aa  61.6  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  28.33 
 
 
807 aa  58.9  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  27.06 
 
 
430 aa  58.5  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  31.1 
 
 
502 aa  58.2  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1879  levansucrase  24 
 
 
377 aa  57.4  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  24.41 
 
 
550 aa  56.2  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  25 
 
 
1527 aa  55.8  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  35.71 
 
 
203 aa  55.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  25.71 
 
 
512 aa  55.1  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  25.77 
 
 
573 aa  54.3  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0615  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.7 
 
 
341 aa  54.3  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.131346  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  36.84 
 
 
331 aa  52.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  32.5 
 
 
440 aa  52  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  25.77 
 
 
552 aa  49.7  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  26.13 
 
 
2821 aa  49.3  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  24.37 
 
 
613 aa  49.3  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  35.14 
 
 
1131 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  35.14 
 
 
1131 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  27.69 
 
 
434 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.43 
 
 
811 aa  47  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1206  hypothetical protein  29.11 
 
 
854 aa  47.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  40.58 
 
 
293 aa  46.2  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  24.03 
 
 
753 aa  45.8  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  26.95 
 
 
478 aa  45.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.41 
 
 
399 aa  45.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  27.4 
 
 
465 aa  44.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>